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Enregistrement W2133981315 · doi:10.1186/1471-2407-10-636

Polymorphisms in genes involved in the estrogen pathway and mammographic density

2010· article· en· W2133981315 sur OpenAlexafffund
Isabelle Dumas, Caroline Diorio

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDigital Radiography and Breast Imaging
Établissements canadiensThe Quebec Population Health Research NetworkCentre hospitalier universitaire de QuébecHôpital du Saint-SacrementUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Breast Cancer Research Alliance
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismEstrogenInternal medicineEndocrinologyMenarcheEstrogen receptor alphaCYP1B1Breast cancerMedicineBody mass indexAromataseEstrogen receptorCatechol-O-methyl transferaseHormoneBiologyAlleleGeneticsGenotypeGeneCancerCytochrome P450

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in genes involved in the estrogen pathway appear to be associated with breast cancer risk and possibly with mammographic density (MD), but little is known of these associations among premenopausal women. This study examines the association of 11 polymorphisms in five estrogen-related genes (estrogen receptors alpha and beta (ERα, ERβ), 17β-hydroxysteroid dehydrogenase 1 (HSD17B1), catechol-O-methyltransferase (COMT), cytochrome P450 1B1 (CYP1B1)) with premenopausal MD. Effect modification of four estrogen-related factors (parity, age at menarche, hormonal derivatives use and body mass index (BMI)) on this relation is also assessed. METHODS: Polymorphisms were genotyped in 741 premenopausal Caucasian women whose MD was measured in absolute density (AD, cm²) and percent density using a computer-assisted method. Multivariate linear models were used to examine the associations (P(trend)) and interactions (Pi). RESULTS: None of the SNPs showed a statistically significant association with AD. However, each additional rare allele of rs1056836 CYP1B1 was associated with a reduction in AD among nulliparous women (P(trend) = 0.004), while no association was observed among parous women (P(trend) = 0.62; Pi = 0.02). An increase in the number of rare alleles of the HSD17B1 SNP (rs598126 and rs2010750) was associated with an increase in AD among women who never used hormonal derivatives (P(trend) = 0.06 and P(trend) = 0.04, respectively), but with a decrease in AD among past hormonal derivatives users (P(trend) = 0.04; Pi = 0.02 and P(trend) = 0.08; Pi = 0.01, respectively). Moreover, a negative association of rs598126 HSD17B1 SNP with AD was observed among women with higher BMI (>median) (P(trend) = 0.01; Pi = 0.02). A negative association between an increased number of rare alleles of COMT rs4680 SNP and AD was limited to women who never used hormonal derivatives (P(trend) = 0.02; Pi = 0.03) or with late age at menarche (>median) (P(trend) = 0.03; Pi = 0.02). No significant association was observed between polymorphisms in the ERα or ERβ genes and AD. Similar results, although less significant, were observed when MD was assessed in percent density. CONCLUSION: SNPs located in CYP1B1, COMT or HSD17B1 genes seem to be associated with MD in some strata of estrogen-related factors. Our findings suggest that modifying effects of estrogen-related factors should be considered when evaluating associations of polymorphisms in estrogen-related genes with premenopausal mammographic density.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,780

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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