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Enregistrement W2134068294 · doi:10.1111/jeb.12222

Multicoloured greenbeards, bacteriocin diversity and the rock‐paper‐scissors game

2013· article· en· W2134068294 sur OpenAlexfundno aff
Jay M. Biernaskie, Andy Gardner, Stuart A. West

Notice bibliographique

RevueJournal of Evolutionary Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueEvolutionary Game Theory and Cooperation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaRoyal Society
Mots-clésBiologyBacteriocinGenetic diversityEvolutionary dynamicsGeneticsImmunityBalancing selectionPopulationEvolutionary biologyGeneImmune systemGenetic variationBacteriaDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Greenbeard genes identify copies of themselves in other individuals and cause their bearer to behave nepotistically towards those individuals. Bacterial toxins (bacteriocins) exemplify the greenbeard effect because producer strains carry closely linked genes for immunity, such that toxicity is limited to nonproducer strains. Bacteriocin producers can be maintained in a dynamic polymorphism, known as rock-paper-scissors (RPS) dynamics, with immune and susceptible strains. However, it is unclear whether and how such dynamics will be maintained in the presence of multiple toxin types (multiple beard 'colours'). Here, we analyse strain dynamics using models of recurrent patch colonization and population growth. We find that (i) polymorphism is promoted by a small number of founding lineages per patch, strong local resource competition and the occurrence of mutations; (ii) polymorphism can be static or dynamic, depending on the intensity of local interactions and the costs of toxins and immunity; (iii) the occurrence of multiple toxins can promote RPS dynamics; and (iv) strain diversity can be maintained even when toxins differ in toxicity or lineages can exhibit multitoxicity/multi-immunity. Overall, the factors that maintain simple RPS dynamics can also promote the coexistence of multiple toxin types (multiple beard colours), thus helping to explain the remarkable levels of bacteriocin diversity in nature. More generally, we contrast these results with the maintenance of marker diversity in genetic kin recognition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,575
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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