Pooling Cervical Swabs and Testing by Ligase Chain Reaction Are Accurate and Cost-Saving Strategies for Diagnosis of <i>Chlamydia trachomatis</i>
Notice bibliographique
Résumé
Specimen pooling to achieve efficiency when testing urine specimens for Chlamydia trachomatis nucleic acids has been suggested. We pooled endocervical swabs from 1,288 women and also tested individual swabs by ligase chain reaction (LCR). Out of 53 positive specimens, pools of 4 or 8 specimens missed two positives, providing 96.2% accuracy compared to individual test results. Dilution and positive-control spiking experiments showed that negative specimens with inhibitors of LCR in the pool reduced the signal. Conversely, two extra positives, detected only through pooling, were negative by individual testing but became positive after storage, suggesting that fresh positive specimens with labile inhibitors may be positive in a pool because of dilution of inhibitors. For this population of women with a 4% prevalence of C. trachomatis infection, substantial savings in cost of reagents (55 to 63%) and technologist time (50 to 63%) made pooling strategies a desirable alternative to individual testing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».