Coordinated Expression of Pax-5 and FAK1 in Metastasis
Notice bibliographique
Résumé
The Pax-5 gene encodes a B-cell-specific activator protein (BSAP) that plays a key role in B lymphocyte differentiation and embryogenesis. The deregulation of this transcription factor is also linked to B cell malignancies and recently to other cancers. More specifically, the downstream effects of Pax-5 promote cell-cell interactions and mediate the activation of adhesion genes which result in an epithelial phenotypic behavior of human carcinoma cells. To gain a better understanding of Pax-5-mediated gene regulation, we studied available gene expression data in depth and identified several Pax-5 downstream targets. Among these, we found that Pax-5 activity is consistently inversely correlated with the expression of Focal Adhesion Kinase 1 (FAK1). FAK1 is known to enhance migration of cancer cells and promote metastatic dissemination to distant sites. Further analysis looking at genome wide profiling of Pax-5 DNAbinding points to both direct and indirect regulation of FAK1 expression by Pax-5 and its downstream targets. These findings suggest a key role for Pax-5 in phenotypic transitioning during metastasis through the regulation of FAK1 activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».