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Enregistrement W2134171575 · doi:10.1158/0008-5472.can-04-2231

Early Changes in Protein Expression Detected by Mass Spectrometry Predict Tumor Response to Molecular Therapeutics

2004· article· en· W2134171575 sur OpenAlexaff
Michelle L. Reyzer, Robert L. Caldwell, Teresa C. Dugger, James T. Forbes, Christoph A. Ritter, Marta Guix, Carlos L. Arteaga, Richard M. Caprioli

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)IONICS Mass Spectrometry (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthVanderbilt-Ingram Cancer CenterVanderbilt University
Mots-clésCancer researchChemistryApoptosisErbBReceptorPharmacologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biomarkers that predict therapeutic response are essential for the development of anticancer therapies. We have used matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI-MS) to directly analyze protein profiles in mouse mammary tumor virus/HER2 transgenic mouse frozen tumor sections after treatment with the erbB receptor inhibitors OSI-774 and Herceptin. Inhibition of tumor cell proliferation and induction of apoptosis and tumor reduction were predicted by a >80% reduction in thymosin beta4 and ubiquitin levels that were detectable after 16 hours of a single drug dose before any evidence of in situ cellular activity. These effects were time- and dose-dependent, and their spatial distribution in the tumor correlated with that of the small-molecule inhibitor OSI-774. In addition, they predicted for therapeutic synergy of OSI-774 and Herceptin as well as for drug resistance. These results suggest that drug-induced early proteomic changes as measured by MALDI-MS can be used to predict the therapeutic response to established and novel therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations149
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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