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Enregistrement W2134180523 · doi:10.1371/journal.pone.0115698

Selective Calcium Sensitivity in Immature Glioma Cancer Stem Cells

2014· article· en· W2134180523 sur OpenAlexaff
Shimei Wee, Maria Niklasson, Voichita D. Marinescu, Anna Segerman, Linnéa Schmidt, Annika Hermansson, Peter B. Dirks, Karin Forsberg‐Nilsson, Bengt Westermark, Lene Uhrbom, Sten Linnarsson, Sven Nelander, Michael Andäng

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBarncancerfondenCancerfondenVetenskapsrådetKarolinska InstitutetSwedish Cancer Foundation
Mots-clésNeural stem cellGliomaNestinTranscriptomeStem cellBiologyMolecular biologyCell biologyCancer researchGene expressionGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tumor-initiating cells are a subpopulation in aggressive cancers that exhibit traits shared with stem cells, including the ability to self-renew and differentiate, commonly referred to as stemness. In addition, such cells are resistant to chemo- and radiation therapy posing a therapeutic challenge. To uncover stemness-associated functions in glioma-initiating cells (GICs), transcriptome profiles were compared to neural stem cells (NSCs) and gene ontology analysis identified an enrichment of Ca2+ signaling genes in NSCs and the more stem-like (NSC-proximal) GICs. Functional analysis in a set of different GIC lines regarding sensitivity to disturbed homeostasis using A23187 and Thapsigargin, revealed that NSC-proximal GICs were more sensitive, corroborating the transcriptome data. Furthermore, Ca2+ drug sensitivity was reduced in GICs after differentiation, with most potent effect in the NSC-proximal GIC, supporting a stemness-associated Ca2+ sensitivity. NSCs and the NSC-proximal GIC line expressed a larger number of ion channels permeable to potassium, sodium and Ca2+. Conversely, a higher number of and higher expression levels of Ca2+ binding genes that may buffer Ca2+, were expressed in NSC-distal GICs. In particular, expression of the AMPA glutamate receptor subunit GRIA1, was found to associate with Ca2+ sensitive NSC-proximal GICs, and decreased as GICs differentiated along with reduced Ca2+ drug sensitivity. The correlation between high expression of Ca2+ channels (such as GRIA1) and sensitivity to Ca2+ drugs was confirmed in an additional nine novel GIC lines. Calcium drug sensitivity also correlated with expression of the NSC markers nestin (NES) and FABP7 (BLBP, brain lipid-binding protein) in this extended analysis. In summary, NSC-associated NES+/FABP7+/GRIA1+ GICs were selectively sensitive to disturbances in Ca2+ homeostasis, providing a potential target mechanism for eradication of an immature population of malignant cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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