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Enregistrement W2134192536 · doi:10.1096/fj.11-195065

A functional microsatellite of the <i>macrophage migration inhibitory factor</i> gene associated with meningococcal disease

2011· article· en· W2134192536 sur OpenAlexaff
Pascal Renner, Thierry Roger, Pierre–Yves Bochud, Tom Sprong, Fred C.G.J. Sweep, Murielle Bochud, Saul N. Faust, Elene Haralambous, Helen Betts, A. Chanson, Marlies Knaup Reymond, Elliot Mermel, Véronique Erard, Marcel van Deuren, Robert C. Read, Michael Levin, Thierry Calandra

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMacrophage Migration Inhibitory Factor
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
Mots-clésMacrophage migration inhibitory factorMeningococcal diseaseAlleleImmunologyNeisseria meningitidisBiologySepsisMedicineGeneCytokineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Macrophage migration inhibitory factor (MIF) is an abundantly expressed proinflammatory cytokine playing a critical role in innate immunity and sepsis and other inflammatory diseases. We examined whether functional MIF gene polymorphisms (–794 CATT 5–8 microsatellite and –173 G/C SNP) were associated with the occurrence and outcome of meningococcal disease in children. The CATT 5 allele was associated with the probability of death predicted by the Pediatric Index of Mortality 2 ( P =0.001), which increased in correlation with the CATT 5 copy number ( P =0.04). The CATT 5 allele, but not the —173 G/C alleles, was also associated with the actual mortality from meningoccal sepsis [OR 2.72 (1.2‐6.4), P =0.02]. A family‐based association test ( i.e. , transmission disequilibrium test) performed in 240 trios with 1 afflicted offspring indicated that CATT 5 was a protective allele ( P =0.02) for the occurrence of meningococcal disease. At baseline and after stimulation with Neisseria meningitidis in THP‐1 monocytic cells or in a whole‐blood assay, CATT 5 was found to be a low‐expression MIF allele ( P = 0.005 and P =0.04 for transcriptional activity; P =0.09 and P =0.09 for MIF production). Taken together, these data suggest that polymorphisms of the MIF gene affecting MIF expression are associated with the occurrence, severity, and outcome of meningococcal disease in children.—Renner, P., Roger, T., Bochud, P.‐Y., Sprong, T., Sweep, F. C. G. J., Bochud, M., Faust, S. N., Haralambous, E., Betts, H., Chanson, A.‐L., Reymond, M. K., Mermel, E., Erard, V., van Deuren, M., Read, R. C., Levin, M., Calandra, T. A functional microsatellite of the macrophage migration inhibitory factor gene associated with meningococcal disease. FASEB J. 26, 907–916 (2012). www.fasebj.org

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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