Gas‐phase binding of non‐covalent protein complexes between bovine pancreatic trypsin inhibitor and its target enzymes studied by electrospray ionization tandem mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
The potential of electrospray ionization (ESI) mass spectrometry (MS) to detect non-covalent protein complexes has been demonstrated repeatedly. However, questions about correlation of the solution and gas-phase structures of these complexes still produce vigorous scientific discussion. Here, we demonstrate the evaluation of the gas-phase binding of non-covalent protein complexes formed between bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI) and its target enzymes over a wide range of dissociation constants. Non-covalent protein complexes were detected by ESI-MS. The abundance of the complex ions in the mass spectra is less than expected from the values of the dissociation constants of the complexes in solution. Collisionally activated dissociation (CAD) tandem mass spectrometry (MS/MS) and a collision model for ion activation were used to evaluate the binding of non-covalent complexes in the gas phase. The internal energy required to induce dissociation was calculated for three collision gases (Ne, Ar, Kr) over a wide range of collision gas pressures and energies using an electrospray ionization source. The order of binding energies of the gas-phase ions for non-covalent protein complexes formed by the ESI source and assessed using CAD-MS/MS appears to differ from that of the solution complexes. The implication is that solution structure of these complexes was not preserved in the gas phase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».