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Enregistrement W2134234780 · doi:10.1186/1751-0473-7-2

Changing computational research. The challenges ahead

2012· article· en· W2134234780 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueSource Code for Biology and Medicine · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueScientific Computing and Data Management
Établissements canadiensUniversité TÉLUQUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceData scienceSet (abstract data type)Replication (statistics)Code (set theory)Test (biology)Open researchOpen scienceWorld Wide WebProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The past year has been an interesting one for those interested in reproducible research.There have been great examples of replicability [1,2] in research communication, and examples of horrifying failure of reproducibility (as described in [3]) with serious questions being raised on the ability of our current system of research communication to guarantee, or even encourage, that published research be reproducible or replicable.When we launched the call for papers for Open Research Computation in late 2010 we saw a clear need for higher standards.Computational research should stand out as an exemplar of just how reproducible research can be, yet it falls short more often than not.With modern computational tools it is entirely possible to provide packages which allow direct replication of results.It is possible to provide data and code in the form of a functional virtual machine image along with automated tests to ensure everything is working as expected.But alongside this we can support the reader's ability to modify and re-purpose tools, to run them against new data, indeed to support efforts to deliberately break the system to identify its limitations.In short, to do what we are supposed to do as scientistsreplicate, reproduce, and test the limits of our models and understanding.We deliberately set the bar high, because we felt it should be high, and because we felt that current standards were, in general, not high enough.Over the past year commentaries [4][5][6] have supported these principles, recognizing that there are serious problemsbut few have actually backed up those words with actions.As with data, so with code, journal statements requiring that it be available often lack substancehow is it to be made availableand policies generally lack teeth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,022
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,792
Score d'incertitude au seuil0,768

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0220,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,447
Tête enseignante GPT0,517
Écart entre enseignants0,070 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle