Mitochondrial Genome Sequence Evolution in Chlamydomonas
Notice bibliographique
Résumé
The mitochondrial genomes of the Chlorophyta exhibit significant diversity with respect to gene content and genome compactness; however, quantitative data on the rates of nucleotide substitution in mitochondrial DNA, which might help explain the origin of this diversity, are lacking. To gain insight into the evolutionary forces responsible for mitochondrial genome diversification, we sequenced to near completion the mitochondrial genome of the chlorophyte Chlamydomonas incerta, estimated the evolutionary divergence between Chlamydomonas reinhardtii and C. incerta mitochondrial protein-coding genes and rRNA-coding regions, and compared the relative evolutionary rates in mitochondrial and nuclear genes. Synonymous and nonsynonymous substitution rates do not differ significantly between the mitochondrial and nuclear protein-coding genes. The mitochondrial rRNA-coding regions, however, are evolving much faster than their nuclear counterparts, and this difference might be explained by relaxed functional constraints on the mitochondrial translational apparatus due to the small number of proteins synthesized in Chlamydomonas mitochondria. Substitution rates at synonymous sites in a nonstandard mitochondrial gene (rtl) and at intronic and synonymous sites in nuclear genes expressed at low levels suggest that the mutation rate is similar in these two genetic compartments. Potential evolutionary forces shaping mitochondrial genome evolution in Chlamydomonas are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».