Genotyping of<i>Human parvovirus B19</i>among Brazilian patients with hemoglobinopathies
Notice bibliographique
Résumé
Human parvovirus B19 (B19V) infection can be a life-threatening condition among patients with hereditary (chronic) hemolytic anemias. Our objective was to characterize the infection molecularly among patients with sickle cell disease and thalassemia. Forty-seven patients (37 with sickle cell disease, and 10 with β-thalassemia major) as well as 47 healthy blood donors were examined for B19V infection by anti-B19V IgG enzyme immunoassay, quantitative PCR, which detects all B19V genotypes, and DNA sequencing. B19V viremia was documented in nine patients (19.1%) as two displayed acute infection and the rest had a low titre viremia (mean 3.4 × 10(4) copies/mL). All donors were negative for B19V DNA. Anti-B19V IgG was detected in 55.3% of the patients and 57.4% among the donors. Based on partial NS1 fragments, all patient isolates were classified as genotype 1 and subgenotype 1A. The evolutionary events of the examined partial NS1 gene sequence were associated with a lack of positive selection. The quantification of all B19V genotypes by a single hydrolytic probe is a technically useful method, but it is difficult to establish relationships between B19V sequence characteristics and infection outcome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».