Regulation of oleosin expression in developing peanut (Arachis hypogaea L.) embryos through nucleosome loss and histone modifications
Notice bibliographique
Résumé
Nucleosome loss and histone modifications are important mechanisms for transcriptional regulation. Concomitant changes in chromatin structures of two peanut (Arachis hypogaea L.) oleosin genes, AhOleo17.8 and AhOleo18.5, were examined in relation to transcriptional activity. Spatial and temporal expression analyses showed that both AhOleo17.8 and AhOleo18.5 promoters can adopt three conformational states, an inactive state (in vegetative tissues), a basal activated state (in early maturation embryos), and a fully activated state (in late maturation embryos). Chromatin immunoprecipitation assays revealed an increase of histone H3 acetylation levels at the proximal promoters and coding regions of AhOleo17.8 and AhOleo18.5 associated with basal transcription in early maturation embryos. Meanwhile, a decrease of histone H3K9 dimethylation levels at coding regions of oleosins was observed in early maturation embryos. However, a dramatic decrease in the histone acetylation signal was observed at the core promoters and the coding regions of the two oleosins in the fully activated condition in late maturation embryos. Although a small decrease of histone H3 levels of oleosins chromatin was detected in early maturation embryos, a significant loss of histone H3 levels occurred in late maturation embryos. These analyses indicate that the histone eviction from the proximal promoters and coding regions is associated with the high expression of oleosin genes during late embryos maturation. Moreover, the basal expression of oleosins in early maturation embryos is accompanied by the increase of histone H3 acetylation and decrease of histone H3K9me2.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».