A Structurally Disordered Region at the C Terminus of Capsid Plays Essential Roles in Multimerization and Membrane Binding of the Gag Protein of Human Immunodeficiency Virus Type 1
Notice bibliographique
Résumé
Crystal structures of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) capsid protein (CA) reveal that the last 11 C-terminal amino acids are disordered. This disordered region contains a glycine-rich sequence 353-GVGGP-357 (numbering refers to the initiation methionine of Gag) that is highly conserved within the Gag proteins of HIV-1, HIV-2, and simian immunodeficiency virus, which suggests the importance of this sequence in virus replication. In the present study, we demonstrate that changing any individual residue within this short region in the context of the full-length HIV-1 genome virtually abolishes production of extracellular virus particles, in either the presence or absence of viral protease activity. This severe defect in virus particle production results from impaired Gag multimerization, as well as from decreased Gag association with the cellular membranes, as demonstrated by the results of gradient sedimentation and membrane flotation centrifugation assays. These findings are further supported by the diffuse distribution pattern of the mutant Gag within the cytoplasm, as opposed to the punctate distribution of the wild-type Gag on the plasma membrane. On the basis of these results, we propose that the disordered feature of amino acid stretch 353-GVGGP-357 in the CA crystal forms may have allowed Gag to adopt multiple conformations and that such structural flexibility is needed by Gag in order to construct geometrically complex particles.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».