Regulation of Rtt107 Recruitment to Stalled DNA Replication Forks by the Cullin Rtt101 and the Rtt109 Acetyltransferase
Notice bibliographique
Résumé
RTT107 (ESC4, YHR154W) encodes a BRCA1 C-terminal domain protein that is important for recovery from DNA damage during S phase. Rtt107 is a substrate of the checkpoint kinase Mec1, and it forms complexes with DNA repair enzymes, including the nuclease subunit Slx4, but the role of Rtt107 in the DNA damage response remains unclear. We find that Rtt107 interacts with chromatin when cells are treated with compounds that cause replication forks to arrest. This damage-dependent chromatin binding requires the acetyltransferase Rtt109, but it does not require acetylation of the known Rtt109 target, histone H3-K56. Chromatin binding of Rtt107 also requires the cullin Rtt101, which seems to play a direct role in Rtt107 recruitment, because the two proteins are found in complex with each other. Finally, we provide evidence that Rtt107 is bound at or near stalled replication forks in vivo. Together, these results indicate that Rtt109, Rtt101, and Rtt107, which genetic evidence suggests are functionally related, form a DNA damage response pathway that recruits Rtt107 complexes to damaged or stalled replication forks.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».