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Enregistrement W2134520863 · doi:10.1093/jnci/djp391

Response: Re: Ki67 Index, HER2 Status, and Prognosis of Patients With Luminal B Breast Cancer

2009· article· en· W2134520863 sur OpenAlexaff
Torsten O. Nielsen, Maggie C.U. Cheang, Stephen Chia, David Voduc, Dongxia Gao, Samuel Leung, Philip S. Bernard, Charles M. Perou, Matthew J. Ellis

Notice bibliographique

RevueJNCI Journal of the National Cancer Institute · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensVancouver Coastal Health Research InstituteUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerOncologyInternal medicineMedicineCancerIndex (typography)Gynecology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Howell et al. are interested in using our dataset to address a different but related hypothesis to the one addressed in our recent article, which concerned the value of Ki67 index as a proliferation marker in the context of the intrinsic subtype approach to breast cancer risk assessment. A response to their hypothesis requires quantitative estrogen receptor (ER) and progesterone receptor data for more than 4000 tissue samples in tissue microarrays. Our study on automated quantitative ER assessment ( 1 ) did not reveal evidence that additional prognostic information could be extracted from quantitative ER beyond that already captured by a binary cut point set at approximately 1%. Currently, our dataset has captured complete immunohistochemical information on progesterone receptor in a semiquantitative fashion around visually assessed cut points rather than as a quantitative continuous variable. An extensive reanalysis of the primary image data for ER (possibly by using an improved image analysis approach) and progesterone receptor in a quantitative fashion would, therefore, be necessary to address their inquiry. Our primary image data have been captured, have been published ( 2 , 3 ), and are publicly accessible at http://www.gpecimage.ubc.ca/tma/web/viewer.php . We have therefore invited Howell et al. to access these published digital images and generate the quantitative ER and progesterone receptor scores by whatever system that they feel is appropriate. We are also willing to consider collaborations with other academic groups who wish to conduct similar exercises. We will then test the hypothesis that quantitative hormone receptor data add useful prognostic information in multivariable models incorporating human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) and Ki67 data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,328

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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