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Enregistrement W2134591275 · doi:10.1086/424854

Viral Polymorphism in Human Papillomavirus Types 33 and 35 and Persistent and Transient Infection in the Genital Tract of Women

2004· article· en· W2134591275 sur OpenAlexafffund
Simon Gagnon, Catherine Hankins, Cécile Tremblay, Pierre Forest, Karina Pourreaux, François Coutlée

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensInstitut National de Santé Publique du QuébecHôpital Notre-DameUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésNonsynonymous substitutionVirologyBiologyOdds ratioHPV infectionGenital tractSex organGenotypeLogistic regressionConfidence intervalImmunologyMedicineInternal medicineCervical cancerGeneGeneticsCancerPhysiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Genetic polymorphism in human papillomavirus (HPV)-33 and -35 was investigated in 1055 sexually active women (732 human immunodeficiency virus [HIV] seropositive and 323 HIV seronegative). METHODS: Consecutive genital specimens obtained at 6-month intervals were screened for HPV-33 and -35 by use of MY09-MY11. HPV-33 and -35 isolates from 95 women were analyzed by polymerase chain reaction sequencing of the long control region (LCR), E6, and E7. RESULTS: For HPV-33, 101 (20%) of 506 nucleotides in the LCR were variable, compared with 10 (2.1%) of 483 nucleotides in E6 (P<.001) and 6 (1.9%) of 324 nucleotides in E7 (P<.001). For HPV-35, the proportion of variable nucleotide sites was similar between the LCR and both E6 (P=.54) and E7 (P=.33). The presence of a 78-base pair deletion in HPV-33 (relative risk [RR], 1.8 [95% confidence interval [CI], 1.2-2.7]) and the presence of nonsynonymous E7 variations in HPV-35 (RR, 2.6 [95% CI, 1.4-4.6]) were associated with persistence. When the data for HPV-33 and -35 were combined, infection by HPV isolates with nonsynonymous E7 variations (RR, 2.3 [95% CI, 1.6-3.4]; P=.001) and ethnicity (P=.04) were associated with persistence, whereas age (P = .14) and HIV infection/CD4 cell count status (P=.12) were not significantly associated with persistence, by logistic regression analysis. CONCLUSION: HPV-33 and -35 polymorphism was different between types and was associated with persistence of HPV infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,166

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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