Immunological Characterization of <i>Escherichia coli</i> O157:H7 Intimin γ1
Notice bibliographique
Résumé
Portions of the intimin genes of Escherichia coli O157:H7 strain E319 and of the enteropathogenic E. coli O127:H6 strain E2348/69 were amplified by PCR and cloned into pET-28a+ expression vectors. The entire 934 amino acids (aa) of E. coli O157:H7 intimin, the C-terminal 306 aa of E. coli O157:H7 intimin, and the C-terminal 311 aa of E. coli O127:H6 intimin were expressed as proteins fused with a six-histidine residue tag (six-His tag) in pET-28a+. Rabbit antisera raised against the six-His tag-full-length E. coli O157:H7 intimin protein fusion cross-reacted in slot and Western blots with outer membrane protein preparations from the majority of enterohemorrhagic and enteropathogenic E. coli serotypes which have the intimin gene. The E. coli strains tested included isolates from humans and animals which produce intimin types alpha (O serogroups 86, 127, and 142), beta1 (O serogroups 5, 26, 46, 69, 111, 126, and 128), gamma 1 (O serogroups 55, 145, and 157), gamma 2 (O serogroups 111 and 103), and epsilon (O serogroup 103) and a nontypeable intimin (O serogroup 80), results based on intimin type-specific PCR assays. Rabbit antisera raised against the E. coli O157:H7 C-terminal fusion protein were much more intimin type-specific than those raised against the full-length intimin fusion protein, but some cross-reaction with other intimin types was also observed for these antisera. In contrast, the monoclonal antibody Intgamma1.C11, raised against the C-terminal E. coli O157 intimin, reacted only with preparations from intimin gamma 1-producing E. coli strains such as E. coli O157:H7.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».