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Enregistrement W2134810582 · doi:10.1186/s13048-015-0182-y

Beclin-1 expression is retained in high-grade serous ovarian cancer yet is not essential for autophagy induction in vitro

2015· article· en· W2134810582 sur OpenAlexafffund
Rohann Correa, Yudith Ramos Valdés, Trevor G. Shepherd, Gabriel E. DiMattia

Notice bibliographique

RevueJournal of Ovarian Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensOvarian Cancer CanadaWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchLondon Health Sciences Centre
Mots-clésBECN1AutophagyGene knockdownOvarian cancerBiologyCancer researchCarcinogenesisCell biologyCancerCell cultureApoptosisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Autophagy is a conserved cellular self-digestion mechanism that can either suppress or promote cancer in a context-dependent manner. In ovarian cancer, prevalent mono-allelic deletion of BECN1 (a canonical autophagy-inducer) suggests that autophagy is impaired to promote carcinogenesis and that Beclin-1 is a haploinsufficient tumor suppressor. Nonetheless, autophagy is known to be readily inducible in ovarian cancer cells. We sought to clarify whether Beclin-1 expression is in fact disrupted in ovarian cancer and whether this impacts autophagy regulation. METHODS: BECN1 expression levels were assessed using The Cancer Genome Atlas (TCGA) datasets from 398 ovarian high-grade serous cystadenocarcinomas (HGSC) and protein immunoblot data from HGSC samples obtained at our institution. Knockdown of BECN1 and other autophagy-related gene expression was achieved using siRNA in established human ovarian cancer cell lines (CaOV3, OVCAR8, SKOV3, and HeyA8) and a novel early-passage, ascites-derived cell line (iOvCa147-E2). LC3 immunoblot, autophagic flux assays, transmission electron microscopy and fluorescence microscopy were used to assess autophagy. RESULTS: We observed prevalent mono-allelic BECN1 gene deletion (76%) in TCGA tumors, yet demonstrate for the first time that Beclin-1 protein expression remains relatively unaltered in these and additional samples generated at our institution. Surprisingly, efficient siRNA-mediated Beclin-1 knockdown did not attenuate autophagy induction, whereas knockdown of other autophagy-related genes blocked the process. Beclin-1 knockdown instead decreased cell viability without inducing apoptosis. CONCLUSIONS: Taken together, these data demonstrate that despite its sustained expression, Beclin-1 is dispensable for autophagy induction in ovarian tumor cells in vitro, yet may be retained to promote cell viability by a mechanism independent of autophagy or apoptosis regulation. Overall, this work makes novel observations about tumor expression of Beclin-1 and challenges the accepted understanding of its role in regulating autophagy in ovarian cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,604

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,437
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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