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Enregistrement W2134859868 · doi:10.1086/655781

A Subtype of a<i>Pseudomonas aeruginosa</i>Cystic Fibrosis Epidemic Strain Exhibits Enhanced Virulence in a Murine Model of Acute Respiratory Infection

2010· article· en· W2134859868 sur OpenAlexaff
Melissa Carter, Joanne L. Fothergill, Martin Walshaw, Kumar Rajakumar, Aras Kadioglu, Craig Winstanley

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulencePseudomonas aeruginosaMicrobiologyBiologyCystic fibrosisPathogenBiofilmChronic infectionQuorum sensingRespiratory infectionVirologyImmunologyRespiratory systemBacteriaGeneImmune systemGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The Liverpool epidemic strain (LES) of Pseudomonas aeruginosa is a particularly successful cystic fibrosis (CF) pathogen associated with transmissibility, increased patient morbidity, and, unusually, infection of the non-CF parents of a patient with CF. METHODS: Using assays for virulence-associated exoproducts, biofilm formation, Caenorhabditis elegans killing, and a murine model of acute respiratory infection, we compared the pathogenic behavior of representatives of 4 subtypes of the LES, including LES431, an isolate associated with the infection of a parent without CF. RESULTS: The quorum-sensing-defective lasR mutant LES400 produced less exoproduct and had less C. elegans killing activity than the other LES subtypes, which were represented by LES431, LESB58, and LESB65. LES431 was deficient in biofilm formation, compared with the other LES sub-types. The LES subtypes displayed a range of virulence in the mouse model, with LES431 being by far the most virulent. The genome-sequenced isolate LESB58, effective at establishing infections in a rat model of chronic infection, was the least virulent subtype in the murine acute infection model. CONCLUSIONS: LES isolates display widely variable pathogenic characteristics. LES431, associated with transmission to the non-CF parent of a CF patient, represents a "hypervirulent" subtype more adapted to acute infections than chronic infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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