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Enregistrement W2134928750 · doi:10.1093/jxb/eru424

Transcripts of two ent-copalyl diphosphate synthase genes differentially localize in rice plants according to their distinct biological roles

2014· article· en· W2134928750 sur OpenAlexfundno aff
Tomonobu Toyomasu, Masami Usui, Chizu Sugawara, Yuri Kanno, Arisa Sakai, Hirokazu Takahashi, Mikio Nakazono, Masaharu Kuroda, Koji Miyamoto, Yu Morimoto, Wataru Mitsuhashi, Kazunori Okada, Shinjiro Yamaguchi, Hisakazu Yamane

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceConnaught Fund
Mots-clésATP synthaseBiologyMutantArabidopsisGeneBiosynthesisGibberellinMeristemBiochemistryDiterpeneOryza sativaPhenotypePolyketide synthaseGeneticsCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gibberellins (GAs) are diterpenoid phytohormones that regulate various aspects of plant growth. Tetracyclic hydrocarbon ent-kaurene is a biosynthetic intermediate of GAs, and is converted from geranylgeranyl diphosphate, a common precursor of diterpenoids, via ent-copalyl diphosphate (ent-CDP) through successive cyclization reactions catalysed by two distinct diterpene synthases, ent-CDP synthase and ent-kaurene synthase. Rice (Oryza sativa L.) has two ent-CDP synthase genes, OsCPS1 and OsCPS2. It has been thought that OsCPS1 participates in GA biosynthesis, while OsCPS2 participates in the biosynthesis of phytoalexins, phytocassanes A-E, and oryzalexins A-F. It has been shown previously that loss-of-function OsCPS1 mutants display a severe dwarf phenotype caused by GA deficiency despite possessing another ent-CDP synthase gene, OsCPS2. Here, experiments were performed to account for the non-redundant biological function of OsCPS1 and OsCPS2. Quantitative reverse transcription-PCR (qRT-PCR) analysis showed that OsCPS2 transcript levels were drastically lower than those of OsCPS1 in the basal parts, including the meristem of the second-leaf sheaths of rice seedlings. qRT-PCR results using tissue samples prepared by laser microdissection suggested that OsCPS1 transcripts mainly localized in vascular bundle tissues, similar to Arabidopsis CPS, which is responsible for GA biosynthesis, whereas OsCPS2 transcripts mainly localized in epidermal cells that address environmental stressors such as pathogen attack. Furthermore, the OsCPS2 transgene under regulation of the OsCPS1 promoter complemented the dwarf phenotype of an OsCPS1 mutant, oscps1-1. The results indicate that transcripts of the two ent-CDP synthase genes differentially localize in rice plants according to their distinct biological roles, OsCPS1 for growth and OsCPS2 for defence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,696

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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