Contrasting Gene Expression Profiles in Two Canine Models of Atrial Fibrillation
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Gene-expression changes in atrial fibrillation patients reflect both underlying heart-disease substrates and changes because of atrial fibrillation-induced atrial-tachycardia remodeling. These are difficult to separate in clinical investigations. This study assessed time-dependent mRNA expression-changes in canine models of atrial-tachycardia remodeling and congestive heart failure. Five experimental groups (5 dogs/group) were submitted to atrial (ATP, 400 bpm x 24 hours, 1 or 6 weeks) or ventricular (VTP, 240 bpm x 24 hours or 2 weeks) tachypacing. The expression of approximately 21,700 transcripts was analyzed by microarray in isolated left-atrial cardiomyocytes and (for 18 genes) by real-time RT-PCR. Protein-expression changes were assessed by Western blot. In VTP, a large number of significant mRNA-expression changes occurred after both 24 hours (2209) and 2 weeks (2720). In ATP, fewer changes occurred at 24 hours (242) and fewer still (87) at 1 week, with no statistically-significant alterations at 6 weeks. Expression changes in VTP varied over time in complex ways. Extracellular matrix-related transcripts were strongly upregulated by VTP consistent with its pathophysiology, with 8 collagen-genes upregulated >10-fold, fibrillin-1 8-fold and MMP2 4.5-fold at 2 weeks (time of fibrosis) but unchanged at 24 hours. Other extracellular matrix genes (eg, fibronectin, lysine oxidase-like 2) increased at both time-points ( approximately 10, approximately 5-fold respectively). In ATP, mRNA-changes almost exclusively represented downregulation and were quantitatively smaller. This study shows that VTP-induced congestive heart failure and ATP produce qualitatively different temporally-evolving patterns of gene-expression change, and that specific transcriptomal responses associated with atrial fibrillation versus underlying heart disease substrates must be considered in assessing gene-expression changes in man.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle