Polygenic risk and the development and course of asthma: an analysis of data from a four-decade longitudinal study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Genome-wide association studies (GWAS) have discovered genetic variants that predispose individuals to asthma. To integrate these new discoveries with emerging models of asthma pathobiology, we aimed to test how genetic discoveries relate to developmental and biological characteristics of asthma. METHODS: In this prospective longitudinal study, we investigated a multilocus profile of genetic risk derived from published GWAS of asthma case status. We then tested associations between this genetic risk score and developmental and biological characteristics of asthma in participants enrolled in a population-based long-running birth cohort, the Dunedin Multidisciplinary Health and Development Study (n=1037). We used data on asthma onset, asthma persistence, atopy, airway hyper-responsiveness, incompletely reversible airflow obstruction, and asthma-related school and work absenteeism and hospital admissions obtained during nine prospective assessments spanning the ages of 9 to 38 years. Analyses included cohort members of European descent from whom genetic data had been obtained. FINDINGS: Of the 880 cohort members included in our analysis, those at higher genetic risk developed asthma earlier in life than did those with lower genetic risk (hazard ratio [HR] 1·12, 95% CI 1·01-1·26). Of cohort members with childhood-onset asthma, those with higher genetic risk were more likely to develop life-course-persistent asthma than were those with a lower genetic risk (relative risk [RR] 1·36, 95% CI 1·14-1·63). Participants with asthma at higher genetic risk more often had atopy (RR 1·07, 1·01-1·14), airway hyper-responsiveness (RR 1·16, 1·03-1·32), and incompletely reversible airflow obstruction (RR 1·28, 1·04-1·57) than did those with a lower genetic risk. They were also more likely to miss school or work (incident rate ratio 1·38, 1·02-1·86) and be admitted to hospital (HR 1·38, 1·07-1·79) because of asthma. Genotypic information about asthma risk was independent of and additive to information derived from cohort members' family histories of asthma. INTERPRETATION: Our findings confirm that GWAS discoveries for asthma are associated with a childhood-onset phenotype. Genetic risk assessments might be able to predict which childhood-onset asthma cases remit and which become life-course-persistent, who might develop impaired lung function, and the burden of asthma in terms of missed school and work and hospital admissions, although these predictions are not sufficiently sensitive or specific to support immediate clinical translation. FUNDING: US National Institute on Aging and UK Medical Research Council.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».