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Enregistrement W2134957581 · doi:10.7554/elife.04872

Actin dynamics tune the integrated stress response by regulating eukaryotic initiation factor 2α dephosphorylation

2015· article· en· W2134957581 sur OpenAlexaff
Joseph E. Chambers, Lucy E. Dalton, Hanna J. Clarke, Elke Malzer, Caia Dominicus, Vruti Patel, Greg B. G. Moorhead, David Ron, Stefan J. Marciniak

Notice bibliographique

RevueeLife · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilWellcomeBritish Lung FoundationDiabetes UKJune Hancock Mesothelioma Research FundWellcome Trust
Mots-clésPhosphorylationCell biologyPhosphataseProtein phosphatase 1BiologyDephosphorylationActinProtein subuniteIF2Initiation factorBiochemistryTranslation (biology)Messenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Four stress-sensing kinases phosphorylate the alpha subunit of eukaryotic translation initiation factor 2 (eIF2α) to activate the integrated stress response (ISR). In animals, the ISR is antagonised by selective eIF2α phosphatases comprising a catalytic protein phosphatase 1 (PP1) subunit in complex with a PPP1R15-type regulatory subunit. An unbiased search for additional conserved components of the PPP1R15-PP1 phosphatase identified monomeric G-actin. Like PP1, G-actin associated with the functional core of PPP1R15 family members and G-actin depletion, by the marine toxin jasplakinolide, destabilised the endogenous PPP1R15A-PP1 complex. The abundance of the ternary PPP1R15-PP1-G-actin complex was responsive to global changes in the polymeric status of actin, as was its eIF2α-directed phosphatase activity, while localised G-actin depletion at sites enriched for PPP1R15 enhanced eIF2α phosphorylation and the downstream ISR. G-actin's role as a stabilizer of the PPP1R15-containing holophosphatase provides a mechanism for integrating signals regulating actin dynamics with stresses that trigger the ISR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,440

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations87
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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