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Enregistrement W2134981162 · doi:10.1074/mcp.m700090-mcp200

Proteomics Analysis of Human Amniotic Fluid

2007· article· en· W2134981162 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular & Cellular Proteomics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Respiratory Health Research
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmniotic fluidProteomicsComputational biologyChemistryBiologyPregnancyFetusBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amniotic fluid is a dynamic and complex mixture that reflects the physiological status of the developing fetus. In this study, the human amniotic fluid (AF) proteome of a 16-18-week normal pregnancy was profiled and analyzed to investigate the composition and functions of this fluid. Due to the complexity of AF, we utilized three different fractionation strategies to provide greater coverage. Two types of two-dimensional LC/MS/MS as well as an LC-SDS-PAGE-LC-MS/MS platform were used. A total of 16 AF samples between gestational ages of 16 and 18 weeks from women carrying chromosomally normal fetuses were analyzed by one of the three fractionation methods followed by a common reverse phase LC-MS/MS step. Mascot and The Global Proteome Machine engines were used to search the International Protein Index human database for peptide sequence identification. The list of proteins was generated by combining the results of both engines through the PeptideProphet of Scaffold software. All identified proteins were combined to generate the AF proteome comprising 1,026 unique gene matches or 842 non-redundant proteins. This list includes most of the currently used biomarkers for pregnancy-associated pathologic conditions such as preterm delivery, intra-amniotic infection, and chromosomal anomalies of the fetus. The subcellular localization, tissue expression, functions, and networks of the AF proteome were analyzed by various bioinformatic tools. These data will contribute to the better understanding of amniotic fluid function and to the discovery of novel biomarkers for prenatal diagnosis of fetal abnormalities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle