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Enregistrement W2135061731 · doi:10.1128/jb.182.12.3582-3586.2000

Megaplasmid pRme2011a of <i>Sinorhizobium meliloti</i> Is Not Required for Viability

2000· article· en· W2135061731 sur OpenAlexaff
Ivan J. Oresnik, Shulin Liu, Christopher K. Yost, Michael F. Hynes

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRepliconSinorhizobium melilotiBiologyRhizobiaceaeStrain (injury)PlasmidSouthern blotGeneGel electrophoresisSymbiosisPulsed-field gel electrophoresisMicrobiologyGeneticsBacteriaGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the curing of the 1,360-kb megaplasmid pRme2011a from Sinorhizobium meliloti strain Rm2011. With a positive selection strategy that utilized Tn5B12-S containing the sacB gene, we were able to cure this replicon by successive rounds of selecting for deletion formation in vivo. Subsequent Southern blot, Eckhardt gel, and pulsed-field gel electrophoresis analyses were consistent with the hypothesis that the resultant strain was indeed missing pRme2011a. The cured derivative grew as well as the wild-type strain in both complex and defined media but was unable to use a number of substrates as a sole source of carbon on defined media.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,167
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations90
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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