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Enregistrement W2135064751 · doi:10.1016/j.str.2012.01.002

Blind Testing of Routine, Fully Automated Determination of Protein Structures from NMR Data

2012· article· en· W2135064751 sur OpenAlexaff
Antonio Rosato, James M. Aramini, C.H. Arrowsmith, Anurag Bagaria, David Baker, Andrea Cavalli, Jurgen F. Doreleijers, Alexander Eletsky, Andrea Giachetti, Paul Guerry, Aleksandras Gutmanas, Peter Güntert, Yunfen He, Torsten Herrmann, Yuanpeng J. Huang, Victor Jaravine, Hendrik R. A. Jonker, Michael A. Kennedy, Oliver F. Lange, Gaohua Liu, Thérèse E. Malliavin, Rajeswari Mani, Binchen Mao, G.T. Montelione, Michaël Nilges, P. Rossi, Gijs van der Schot, Harald Schwalbe, Thomas Szyperski, Michele Vendruscolo, Robert M. Vernon, Wim Vranken, Sjoerd de Vries, Geerten W. Vuister, Bin Wu, Yunhuang Yang, Alexandre M. J. J. Bonvin

Notice bibliographique

RevueStructure · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceNational Institute of General Medical SciencesCentre National de la Recherche ScientifiqueBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilInnovirisVolkswagen FoundationDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésNuclear magnetic resonance spectroscopyComputer scienceNuclear Overhauser effectTwo-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopyProtein structureCASPTask (project management)Protein Data BankData miningNuclear magnetic resonancePhysicsProtein structure predictionEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,018
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,091
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,095

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0180,091
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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