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Enregistrement W2135177362 · doi:10.1111/j.1365-294x.2012.05570.x

Population size and major valleys explain microsatellite variation better than taxonomic units for caribou in western Canada

2012· article· en· W2135177362 sur OpenAlexafffundabout
Robert Serrouya, David Paetkau, Bruce N. McLellan, Stan Boutin, Mitch Campbell, Deborah A. Jenkins

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensGovernment of NunavutGovernment of British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaParks Canada
Mots-clésBiologyPopulation sizeEcotypePopulationSubspeciesRange (aeronautics)Effective population sizeEcologySmall population sizeGenetic variationHabitatDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Identifying conservation units below the species level is becoming increasingly important, particularly when limited resources necessitate prioritization for conservation among such units. This problem is exemplified with caribou, a mammal with a circum-Arctic distribution that is exposed to a broad spectrum of ecological conditions, but is also declining in many parts of its range. We used microsatellite markers to evaluate the suitability of existing intra-specific taxonomic designations to act as population units for conservation and contrasted this with landscape features that were independent of taxonomy. We also quantified the relationship between genetic differentiation and subpopulation size, a factor that has been under-represented in landscape genetic research. Our data set included three subspecies and three ecotypes of caribou that varied in population size by five orders of magnitude. Our results indicated that genetic structure did not correspond to existing taxonomic designation, particularly at the level of ecotype. Instead, we found that major valleys and population size were the strongest factors associated with substructure. There was a negative exponential relationship between population size and F(ST) between pairs of adjacent subpopulations, suggesting that genetic drift was the mechanism causing the structure among the smallest subpopulations. A genetic assignment test revealed that movement among subpopulations was a fraction of the level needed to stabilize smaller subpopulations, indicating little chance for demographic rescue. Such results may be broadly applicable to landscape genetic studies, because population size and corresponding rates of drift have the potential to confound interpretations of landscape effects on population structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,207
Score d'incertitude au seuil0,980

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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