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Enregistrement W2135184355 · doi:10.1158/1055-9965.epi-11-0569

Confirmation of 5p12 As a Susceptibility Locus for Progesterone-Receptor–Positive, Lower Grade Breast Cancer

2011· article· en· W2135184355 sur OpenAlexfundno aff
Roger L. Milne, Ellen L. Goode, Montserrat García‐Closas, Fergus J. Couch, Gianluca Severi, Rebecca Hein, Zachary Fredericksen, Núria Malats, M. Pilar Zamora, José Ignacio Arias Pérez, Javier Benı́tez, Thilo Dörk, Peter Schürmann, Johann H. Karstens, Peter Hillemanns, Angela Cox, Ian W. Brock, Graeme Elliot, Simon S. Cross, Sheila Seal, Clare Turnbull, Anthony Renwick, Nazneen Rahman, Chen‐Yang Shen, Jyh‐Cherng Yu, Chiun‐Sheng Huang, Ming‐Feng Hou, Børge G. Nordestgaard, Stig E. Bojesen, Charlotte Lanng, Grethe Grenaker Alnæs, Vessela N. Kristensen, Anne-Lise Børrensen-Dale, John L. Hopper, Gillian S. Dite, Carmel Apicella, Melissa C. Southey, Diether Lambrechts, Betül T. Yesilyurt, Giuseppe Floris, Karin Leunen, Suleeporn Sangrajrang, Valérie Gaborieau, Paul Brennan, James McKay, Jenny Chang‐Claude, Shan Wang‐Gohrke, Paolo Radice, Paolo Peterlongo, Siranoush Manoukian, Monica Barile, Graham G. Giles, Laura Baglietto, Esther M. John, Alexander Miron, Stephen J. Chanock, Jolanta Lissowska, Mark E. Sherman, Jonine D. Figueroa, Natalia Bogdanova, Natalia Antonenkova, Iosif V. Zalutsky, Yuriy Rogov, Peter A. Fasching, Christian Bayer, Arif B. Ekici, Matthias W. Beckmann, Hermann Brenner, Heiko Müller, Volker Arndt, Christa Stegmaier, Irene L. Andrulis, Julia A. Knight, Gord Glendon, Anna Marie Mulligan, Vesa Kataja, Veli‐Matti Kosma, Jaana M. Hartikainen, Alfons Meindl, Joerg Heil, Claus R. Bartram, Rita K. Schmutzler, Gilles D. Thomas, Robert N. Hoover, Olivia Fletcher, Lorna J. Gibson, Isabel dos‐Santos‐Silva, Julian Peto, Stefan Nickels, Dieter Flesch‐Janys, Hoda Anton‐Culver, Argyrios Ziogas, Elinor J. Sawyer, Ian Tomlinson, Michael J. Kerin, Nicola Miller, Marjanka K. Schmidt, Annegien Broeks, Laura van ‘t Veer, Rob A.�E.�M. Tollenaar, Paul D.P. Pharoah, Alison M. Dunning, Karen A. Pooley, Frederik Marmé, Andreas Schneeweiß, Christof Sohn, Barbara Burwinkel, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Katarzyna Jaworska, Katarzyna Durda, Daehee Kang, Keun-Young Yoo, Dong‐Young Noh, Sei-Hyun Ahn, David J. Hunter, Susan E. Hankinson, Peter Kraft, Sara Lindström, Jonathan Beesley, Ute Hamann, Volker Harth, Christina Justenhoven, Robert Winqvist, Katri Pylkäs, Arja Jukkola‐Vuorinen, Mervi Grip, Maartje J. Hooning, Antoinette Hollestelle, Rogier A. Oldenburg, Madeleine M.A. Tilanus‐Linthorst, Э. К. Хуснутдинова, Marina Bermisheva, Darya Prokofieva, Albina Farahtdinova, Janet E. Olson, Xianshu Wang, Manjeet K. Humphreys, Qin Wang, Georgia Chenevix‐Trench, Douglas F. Easton

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCancer Council TasmaniaNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilU.S. ArmyAlleanza Contro il CancroUniversität UlmMedical Research and Materiel CommandFondazione Italiana per la Ricerca sul CancroCancer Council VictoriaOulun YliopistoDeutsche KrebshilfeMedizinischen Hochschule HannoverNorges ForskningsrådCancer Research UKKWF KankerbestrijdingWellcome TrustHerlev HospitalRobert Bosch StiftungBundesministerium für Bildung und ForschungNational Breast Cancer FoundationNational Institute for Health and Care ResearchAcademia SinicaEuropean CommissionKing's College LondonNational Cancer InstituteKuopion Yliopistollinen SairaalaBreast Cancer CampaignNational Institutes of HealthDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungMinistero della SaluteAcademy of FinlandCancer Care OntarioDeutsches KrebsforschungszentrumInstitute of Biomedical Sciences, Academia SinicaAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroLon V. Smith FoundationItä-Suomen YliopistoSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådTaiwan BiobankU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésBreast cancerProgesterone receptorLocus (genetics)MedicineInternal medicineOncologyGynecologyCancerEndocrinologyBiologyEstrogen receptorGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The single-nucleotide polymorphism (SNP) 5p12-rs10941679 has been found to be associated with risk of breast cancer, particularly estrogen receptor (ER)-positive disease. We aimed to further explore this association overall, and by tumor histopathology, in the Breast Cancer Association Consortium. METHODS: Data were combined from 37 studies, including 40,972 invasive cases, 1,398 cases of ductal carcinoma in situ (DCIS), and 46,334 controls, all of white European ancestry, as well as 3,007 invasive cases and 2,337 controls of Asian ancestry. Associations overall and by tumor invasiveness and histopathology were assessed using logistic regression. RESULTS: For white Europeans, the per-allele OR associated with 5p12-rs10941679 was 1.11 (95% CI = 1.08-1.14, P = 7 × 10(-18)) for invasive breast cancer and 1.10 (95% CI = 1.01-1.21, P = 0.03) for DCIS. For Asian women, the estimated OR for invasive disease was similar (OR = 1.07, 95%CI = 0.99-1.15, P = 0.09). Further analyses suggested that the association in white Europeans was largely limited to progesterone receptor (PR)-positive disease (per-allele OR = 1.16, 95% CI = 1.12-1.20, P = 1 × 10(-18) vs. OR = 1.03, 95% CI = 0.99-1.07, P = 0.2 for PR-negative disease; P(heterogeneity) = 2 × 10(-7)); heterogeneity by ER status was not observed (P = 0.2) once PR status was accounted for. The association was also stronger for lower grade tumors [per-allele OR (95% CI) = 1.20 (1.14-1.25), 1.13 (1.09-1.16), and 1.04 (0.99-1.08) for grade 1, 2, and 3/4, respectively; P(trend) = 5 × 10(-7)]. CONCLUSION: 5p12 is a breast cancer susceptibility locus for PR-positive, lower grade breast cancer. IMPACT: Multicenter fine-mapping studies of this region are needed as a first step to identifying the causal variant or variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,924

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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