Diptera-Specific Polymerase Chain Reaction Amplification Primers of use in Molecular Phylogenetic Research
Notice bibliographique
Résumé
Abstract DNA sequence data from a variety of mitochondrial and nuclear gene regions are significant components of phylogenetic research in entomology. Polymerase chain reaction (PCR) amplification primers for many gene regions have been developed that are specific to a range of dipteran groups. Here, we review the existing Diptera-specific PCR amplification primers that have been published for 11 mitochondrial and nuclear gene regions: 12S small ribosomal subunit, cytochrome b, cytochrome oxidase c subunit I, 28S ribosomal RNA, alanyl-tRNA synthetase, the carbamoyl phosphate synthase region of CAD, elongation factor-1α, 6-phosphogluconate dehydrogenase, triose phosphate isomerase, white, and wingless. We also have designed in total 94 new PCR amplification primers for use in these same gene regions. Our new primers have been developed and tested using our DNA sequence database of > 1,600 specimens representing 40 families of Diptera. All of the past and newly developed primer sequences are presented in tables, and their locations are shown on gene maps. This combined data will facilitate future molecular phylogenetic research within Diptera.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».