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Enregistrement W2135217751

Enhancement of RNA interference effect in P19 EC cells by an RNA-dependent RNA polymerase.

2009· article· en· W2135217751 sur OpenAlexaff
Fariba Esmaeili

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensOttawa Regional Cancer Foundation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNA interferenceRNA silencingBiologySmall interfering RNAGene silencingMolecular biologyRNASmall hairpin RNATrans-acting siRNAGene expressionDNA-directed RNA interferenceRNA-dependent RNA polymeraseTransfectionCell biologyRNA-induced silencing complexGeneGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: RNA interference (RNAi) is a phenomenon uses double-stranded RNA (dsRNA) to specifically inhibit gene expression. The non-specific silencing caused by interferon response to dsRNA in mammalian cells limits the potential of utilizing RNAi to study gene function. Duplexes of 21-nucleotide short interfering dsRNA (siRNA) inhibit gene expression by RNAi. In some organisms, siRNA can also function as a primer converting mRNA into dsRNA that are further cleaved to produce more siRNA. This activity involves the enzyme RNA-dependent RNA polymerase (RdRP). There are no known RdRP involved in RNAi in mammals. By using an RdRP from Caenorhabditis elegance named ego-1, investigators intend to enhance RNAi effect in mammalian cells. The aims of this project were: 1) to investigate the efficiency of siRNA to enhanced green fluorescent protein (eGFP) gene silencing and 2) to enhance the RNAi effect. METHODS: We used a vector-based siRNA to target eGFP. Also we used a vector expressing ego-1 to test for a possible amplification effect of RNAi. The expression of eGFP in the cells was detected by using fluorescent microscopy, flowcytometry and Western-blotting. RESULTS: Transfection of the plasmid into P19 cells significantly decreased eGFP fluorescence. In addition, eGFP protein was reduced. Preliminary data suggested that the presence of ego-1 enhanced the RNAi effect. CONCLUSION: The results indicated that use of hairpin siRNA expression vectors for RNAi is a promising method to inhibition of gene expression in mammalian cells. Also, introducing RdRP enzyme to mammalian cells might amplify the RNAi effect in the cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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