C2ORF29/CNOT11 and CNOT10 form a new module of the CCR4-NOT complex
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Notice bibliographique
Résumé
The CCR4-NOT complex was originally identified and its composition and organization characterized in the yeast Saccharomyces cerevisiae. It was first suggested to participate in transcription regulation, but since then it has become clear that it plays a key role in mRNA decay in all eukaryotes, thereby contributing importantly to gene expression regulation. Hence, the mammalian CCR4-NOT complex was recently shown to participate in miRNA-mediated mRNA repression. A better characterization of the composition and organization of this complex in higher eukaryotes is thus warranted. Purifications of the CCR4-NOT complex, performed by others and us, suggest that the protein of unknown function C2ORF29 is associated with this assembly. We demonstrate here that C2ORF29 is indeed a bona fide subunit of the human CCR4-NOT complex and propose to rename it CNOT11. In addition, we show that CNOT11 interacts with the first amino acids of CNOT1 and with CNOT10 and is required for the association of CNOT10 with the CCR4-NOT complex. Thus, the human CCR4-NOT complex possesses in addition to the CCR4-CAF1 deadenylase module and to the NOT module, a module composed of CNOT10 and CNOT11 that interacts with the N-terminal part of CNOT1. Phylogenetic analyses indicate that the CNOT10/CNOT11 module is conserved in all eukaryotes except fungi.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle