MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2135263357 · doi:10.4049/jimmunol.1302826

Presence of CD8+ T Cells in the Ectocervical Mucosa Correlates with Genital Viral Shedding in HIV-Infected Women despite a Low Prevalence of HIV RNA–Expressing Cells in the Tissue

2014· article· en· W2135263357 sur OpenAlexaff
Anna Gibbs, Taha Hirbod, Qingsheng Li, Karin Bohman, T. Blake Ball, Francis A. Plummer, Rupert Kaul, Joshua Kimani, Kristina Broliden, Annelie Tjernlund

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésViral loadCD8ImmunologyIn situ hybridizationVirologyViral sheddingVirusCD3BiologySex organMedicineImmune systemGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The female genital tract is a portal of entry for sexual HIV transmission and a possible viral reservoir. In this study, the ectocervical CD8+ T cell distribution was explored in situ and was related to expression of CD3 and HLA-DR and presence of HIV RNA. For this purpose, ectocervical tissue samples and genital secretions were collected from HIV-seropositive (HIV+) Kenyan female sex workers (FSWs) (n = 20), HIV-seronegative (HIV-) FSWs (n = 17), and HIV(-) lower-risk women (n = 21). Cell markers were assessed by in situ staining and by quantitative PCR. HIV RNA expression in tissue was analyzed by in situ hybridization, and viral shedding was assessed by quantitative PCR. The HIV+ FSW group had a higher amount of total cells and CD8+, CD3+, and HLA-DR+ cells compared with the HIV(-)FSW group and HIV- lower-risk women. The majority of CD8+ cells were CD3+ T cells, and the numbers of CD8+ cells correlated significantly with plasma and cervical viral load. HIV RNA expression in situ was found in 4 of the 20 HIV+FSW women but did not correlate with cervical or plasma viral load. Thus, the HIV+ women displayed high numbers of CD8+, CD3+, and HLA-DR+ cells, as well as a limited number of HIV RNA+ cells, in their ectocervical mucosa; hence, this localization cannot be neglected as a potential viral reservoir. The elevated levels of CD8+ T cells may play a role in the immunopathogenesis of HIV in the female genital tract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Immunology→Même sujetHIV Research and Treatment→Travaux en français237 207→