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Enregistrement W2135301365 · doi:10.1002/elps.200305824

Application of capillary electrophoresis‐ electrospray‐mass spectrometry to the separation and characterization of isomeric lipopolysaccharides of <b><i>Neisseria meningitidis</i></b>

2004· article· en· W2135301365 sur OpenAlexaff
Jianjun Li, Andrew D. Cox, Derek W. Hood, E. Richard Moxon, James C. Richards

Notice bibliographique

RevueElectrophoresis · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAnalytical Chemistry and Chromatography
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryChromatographyCapillary electrophoresisElectrosprayMass spectrometryElectrospray ionizationTandem mass spectrometryNeisseria meningitidisAnalytical Chemistry (journal)Bacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A capillary electrophoresis-electrospray-mass spectrometry technique for the characterization of lipopolysaccharides (LPSs) was developed, permitting the separation of trace-level O-deacylated LPS isoforms for subsequent structural characterization using tandem mass spectrometry (MS/MS). The separation buffer and electrospray interface were optimized first using O-deacylated LPS samples from large-scale preparations. It was found that with microelectrospray or sheath-solution interface, we could separate LPS in anionic forms and detect them using either negative or positive ion mode MS. For negative ion detection mode MS, 30 mM morpholine with addition of 5% v/v methanol was employed as separation buffer. When positive ion detection mode MS was required, 10 mM ammonium acetate with addition of 5% methanol was used as separation buffer. The structural assignments obtained from MS/MS and capillary zone electrophoresis-electrospray-MS (CZE-ESMS) analyses enabled the identification of isomeric glycoforms. Application of this technique to the analysis of LPS from the galE mutants of Neisseria meningitidis strain BZ157 B5+ revealed the presence of isomeric glycoforms, in which the location of a functional group phosphoethanolamine was found to be in either inner core or lipid A-OH regions. The described technique was also applied to the analysis of LPS samples from the galE mutant of N. meningitidis strains F1576 A4+ and A4-. The occurrence of isomeric LPS glycoforms differing by the location or presence of neutral sugar residues, such as hexoses, can also be characterized using MS/MS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,932

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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