An Antirepressor, SrpR, Is Involved in Transcriptional Regulation of the SrpABC Solvent Tolerance Efflux Pump of Pseudomonas putida S12
Notice bibliographique
Résumé
Organic compounds exhibit various levels of toxicity toward living organisms based upon their ability to insert into biological membranes and disrupt normal membrane function. The primary mechanism responsible for organic solvent tolerance in many bacteria is energy-dependent extrusion via efflux pumps. One such bacterial strain, Pseudomonas putida S12, is known for its high tolerance to organic solvents as provided through the SrpABC resistance-nodulation-cell division (RND) family efflux pump. To determine how two putative regulatory proteins (SrpR and SrpS, encoded directly upstream of the SrpABC structural genes) influence SrpABC efflux pump expression, we conducted transcriptional analysis, β-galactosidase fusion experiments, electrophoretic mobility shift assays, and pulldown analysis. Together, the results of these experiments suggest that expression of the srpABC operon can be derepressed by two distinct but complementary mechanisms: direct inhibition of the SrpS repressor by organic solvents and binding of SrpS by its antirepressor SrpR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».