Functional analysis of a cinnamyl alcohol dehydrogenase involved in lignin biosynthesis in wheat
Notice bibliographique
Résumé
Cinnamyl alcohol dehydrogenase (CAD) catalyses the final step in the biosynthesis of monolignols. In the present study, a cDNA encoding a CAD was isolated from wheat, designated as TaCAD1. A genome-wide data mining in the wheat EST database revealed another 10 CAD-like homologues, namely TaCAD2 to TaCAD11. A phylogenetic analysis showed that TaCAD1 belonged to the bona fide CAD group involved in lignin synthesis. Two other putative CADs from the wheat genome (TaCAD2 and TaCAD4) also belonged to this group and were very close to TaCAD1, but lacked C-terminal domain, suggesting that they are pseudogenes. DNA gel blot analysis for the wheat genome showed two to three copies of CAD related to TaCAD1, but RNA gel blot analysis revealed only single band for TaCAD1, which was highly expressed in stem, with quite low expression in leaf and undetectable expression in root. The predicted three-dimension structure of TaCAD1 resembled that of AtCAD5, but two amino acid substitutions were identified in the substrate binding region. Recombinant TaCAD1 protein used coniferyl aldehyde as the most favoured substrate, also showed high efficiencies toward sinapyl and p-coumaryl aldehydes. TaCAD1 was an enzyme being pH-dependent and temperature-sensitive, and showing a typical random catalysing mechanism. At the milky stage of wheat, TaCAD1 mRNA abundance, protein level and enzyme activity in stem tissues were higher in a lodging-resistant cultivar (H4546) than in lodging-sensitive cultivar (C6001). These properties were correlated to the lignin contents and lodging indices of the two cultivars. These data suggest that TaCAD1 is the predominant CAD in wheat stem for lignin biosynthesis and is critical for lodging resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».