First Report of Gray Mold of Blackberry Caused by <i>Botrytis cinerea</i> in South Carolina
Notice bibliographique
Résumé
Botrytis cinerea Pers.: Fr. is a causal agent of gray mold of blackberry but may also affect grapevine, tomato, bulb flowers, and ornamental crops (2). In August 2010, blackberries (Rubus fruticosus and other species) showing gray mold symptoms were found in Longcreek, Six Mile, and Cheddar, SC. Symptomatic blackberry fruit exhibited patterns of brown-to-gray mycelia and conidiophores. Upon isolation, the mycelium grew at a rate of 12.3 mm per day at 22°C on potato dextrose agar, forming pale white-to-gray colonies with concentric rings and conidiophores (less than 12 h of fluorescent light per day). Some isolates formed dark brown sclerotia in the dark after 18 days. The lemon-shaped spores averaged 12 × 9 μm and were consistent with descriptions of B. cinerea. (1) The ribosomal internal transcribed spacer (ITS) ITS1-5.8S-ITS2 region was amplified via PCR from genomic DNA obtained from mycelia using primers ITS1 and ITS4. A BLAST search in GenBank revealed highest similarity (99 to 100%) to sequences from various Botrytis spp. collected in China, Canada, and Spain (GenBank Accession Nos. FJ169666.1, GU934505.1, and EF207414.1). The ITS sequence amplified from the blackberry isolate was submitted to GenBank (Accession No. JN164269). The pathogen was further identified to the species level as B. cinerea using glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, heat-shock protein 60 (HSP60), and DNA-dependent RNA polymerase subunit II (RPB2) gene sequences (2) (GenBank Accession Nos. JN164270, JN164271, JN164272). Pathogenicity was confirmed by inoculating three surface-sterilized (soaked in 5% bleach for 15 min), mature blackberry fruit (R. fruticosus) with a conidial suspension (105 spores/ml) of the blackberry isolate. A 20-μl droplet was placed on the fruit; control fruit received sterile water without conidia. After 5 days of incubation at room temperature in an air-tight Magenta box, the inoculated fruit developed typical signs and symptoms of gray mold. The developing spores on inoculated fruit were confirmed to be B. cinerea. All control fruit remained healthy. To our knowledge, this is the first report of B. cinerea on blackberry in South Carolina. The disease must be managed with fungicides to obtain high quality fruit with market-requested shelf life. References: (1) D. F. Farr and A. Y. Rossman. Fungal Databases. Systematic Mycology and Microbiology Laboratory, ARS, USDA. Retrieved from http://nt.ars-grin.gov/fungaldatabases/ , June 17, 2011. (2) M. Staats et al. Mol. Biol. Evol. 22:333, 2005.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».