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Enregistrement W2135530417 · doi:10.1094/pdis-06-11-0530

First Report of Gray Mold of Blackberry Caused by <i>Botrytis cinerea</i> in South Carolina

2011· article· en· W2135530417 sur OpenAlexaboutno aff
X. Li, Guido Schnabel

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBotrytis cinereaBiologyConidiumGenBankBotanyMyceliumInternal transcribed spacerPotato dextrose agarBotrytisSporeAccession number (library science)HorticultureRibosomal RNAGeneAgar

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Botrytis cinerea Pers.: Fr. is a causal agent of gray mold of blackberry but may also affect grapevine, tomato, bulb flowers, and ornamental crops (2). In August 2010, blackberries (Rubus fruticosus and other species) showing gray mold symptoms were found in Longcreek, Six Mile, and Cheddar, SC. Symptomatic blackberry fruit exhibited patterns of brown-to-gray mycelia and conidiophores. Upon isolation, the mycelium grew at a rate of 12.3 mm per day at 22°C on potato dextrose agar, forming pale white-to-gray colonies with concentric rings and conidiophores (less than 12 h of fluorescent light per day). Some isolates formed dark brown sclerotia in the dark after 18 days. The lemon-shaped spores averaged 12 × 9 μm and were consistent with descriptions of B. cinerea. (1) The ribosomal internal transcribed spacer (ITS) ITS1-5.8S-ITS2 region was amplified via PCR from genomic DNA obtained from mycelia using primers ITS1 and ITS4. A BLAST search in GenBank revealed highest similarity (99 to 100%) to sequences from various Botrytis spp. collected in China, Canada, and Spain (GenBank Accession Nos. FJ169666.1, GU934505.1, and EF207414.1). The ITS sequence amplified from the blackberry isolate was submitted to GenBank (Accession No. JN164269). The pathogen was further identified to the species level as B. cinerea using glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, heat-shock protein 60 (HSP60), and DNA-dependent RNA polymerase subunit II (RPB2) gene sequences (2) (GenBank Accession Nos. JN164270, JN164271, JN164272). Pathogenicity was confirmed by inoculating three surface-sterilized (soaked in 5% bleach for 15 min), mature blackberry fruit (R. fruticosus) with a conidial suspension (105 spores/ml) of the blackberry isolate. A 20-μl droplet was placed on the fruit; control fruit received sterile water without conidia. After 5 days of incubation at room temperature in an air-tight Magenta box, the inoculated fruit developed typical signs and symptoms of gray mold. The developing spores on inoculated fruit were confirmed to be B. cinerea. All control fruit remained healthy. To our knowledge, this is the first report of B. cinerea on blackberry in South Carolina. The disease must be managed with fungicides to obtain high quality fruit with market-requested shelf life. References: (1) D. F. Farr and A. Y. Rossman. Fungal Databases. Systematic Mycology and Microbiology Laboratory, ARS, USDA. Retrieved from http://nt.ars-grin.gov/fungaldatabases/ , June 17, 2011. (2) M. Staats et al. Mol. Biol. Evol. 22:333, 2005.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,141

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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