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Enregistrement W2135581280 · doi:10.1099/jmm.0.022350-0

Identification of mutants with altered phenazine production in Pseudomonas aeruginosa

2010· article· en· W2135581280 sur OpenAlexaff
Haihua Liang, Jiali Duan, Christopher D. Sibley, Michael G. Surette, Kangmin Duan

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPyocyaninPseudomonas aeruginosaVirulenceSwarming motilityOperonQuorum sensingBiologyMutantPhenazineMicrobiologyBiofilmGeneVirulence factorHuman pathogenHomoserineGeneticsBacteriaBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic human pathogen that causes serious and chronic infections. Many secondary metabolites are secreted throughout its growth, among which phenazine is a known virulence factor and signalling molecule. Phenazine is coordinately controlled by the global regulatory quorum-sensing (QS) systems. Despite the detailed understanding of phenazine biosynthesis pathways in P. aeruginosa, the regulatory networks are still not fully clear. In the present study, the regulation of the phzA1B1C1D1E1F1G1 operon (phzA1) has been investigated. Screening of 5000 transposon mutants revealed 14 interrupted genes with altered phzA1 expression, including PA2593 (QteE), which has been identified as a novel regulator of the QS system. Overexpression of qteE in P. aeruginosa significantly reduced the accumulation of homoserine lactone signals and affected the QS-controlled phenotypes such as the production of pyocyanin, rhamnolipids and LasA protease and swarming motility. Indeed, overexpression of qteE in P. aeruginosa attenuated its pathogenicity in the potato and fruit fly infection models. These findings suggest that qteE plays an important role in P. aeruginosa pathogenicity and is part of the regulatory networks controlling phenazine production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,237

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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