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Enregistrement W2135588963 · doi:10.1104/pp.102.015255

Expression Profiling and Bioinformatic Analyses of a Novel Stress-Regulated Multispanning Transmembrane Protein Family from Cereals and Arabidopsis,

2003· article· en· W2135588963 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome Canada
Mots-clésArabidopsisBiologyGeneGene familyGeneticsTransmembrane proteinGene expression profilingGenomeThylakoidMembrane proteinProtein familyGene expressionCell biologyChloroplastReceptorMutantMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cold acclimation is a multigenic trait that allows hardy plants to develop efficient tolerance mechanisms needed for winter survival. To determine the genetic nature of these mechanisms, several cold-responsive genes of unknown function were identified from cold-acclimated wheat (Triticum aestivum). To identify the putative functions and structural features of these new genes, integrated genomic approaches of data mining, expression profiling, and bioinformatic predictions were used. The analyses revealed that one of these genes is a member of a small family that encodes two distinct groups of multispanning transmembrane proteins. The cold-regulated (COR)413-plasma membrane and COR413-thylakoid membrane groups are potentially targeted to the plasma membrane and thylakoid membrane, respectively. Further sequence analysis of the two groups from different plant species revealed the presence of a highly conserved phosphorylation site and a glycosylphosphatidylinositol-anchoring site at the C-terminal end. No homologous sequences were found in other organisms suggesting that this family is specific to the plant kingdom. Intraspecies and interspecies comparative gene expression profiling shows that the expression of this gene family is correlated with the development of freezing tolerance in cereals and Arabidopsis. In addition, several members of the family are regulated by water stress, light, and abscisic acid. Structure predictions and comparative genome analyses allow us to propose that the cor413 genes encode putative G-protein-coupled receptors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,215
Score d'incertitude au seuil0,241

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle