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Enregistrement W2135611962 · doi:10.1136/jamia.2010.003210

Developing syndrome definitions based on consensus and current use

2010· article· en· W2135611962 sur OpenAlexaff
Wendy W. Chapman, John Dowling, Atar Baer, David L. Buckeridge, Dennis G. Cochrane, Michael Conway, Peter L. Elkin, Jeremy U. Espino, Julia Gunn, Craig M. Hales, Lori Hutwagner, Mikaela Keller, Catherine Larson, Rebecca S. Noe, Anya Okhmatovskaia, Karen L. Olson, Marc Paladini, Matthew J. Scholer, Carol Sniegoski, David Thompson, Bill Lober

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Medical Informatics Association · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesU.S. National Library of Medicine
Mots-clésComputer scienceConsensus conferenceOntologyMEDLINEData scienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Standardized surveillance syndromes do not exist but would facilitate sharing data among surveillance systems and comparing the accuracy of existing systems. The objective of this study was to create reference syndrome definitions from a consensus of investigators who currently have or are building syndromic surveillance systems. DESIGN: Clinical condition-syndrome pairs were catalogued for 10 surveillance systems across the United States and the representatives of these systems were brought together for a workshop to discuss consensus syndrome definitions. RESULTS: Consensus syndrome definitions were generated for the four syndromes monitored by the majority of the 10 participating surveillance systems: Respiratory, gastrointestinal, constitutional, and influenza-like illness (ILI). An important element in coming to consensus quickly was the development of a sensitive and specific definition for respiratory and gastrointestinal syndromes. After the workshop, the definitions were refined and supplemented with keywords and regular expressions, the keywords were mapped to standard vocabularies, and a web ontology language (OWL) ontology was created. LIMITATIONS: The consensus definitions have not yet been validated through implementation. CONCLUSION: The consensus definitions provide an explicit description of the current state-of-the-art syndromes used in automated surveillance, which can subsequently be systematically evaluated against real data to improve the definitions. The method for creating consensus definitions could be applied to other domains that have diverse existing definitions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,078
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,199
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,922
Score d'incertitude au seuil0,410

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0780,199
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0180,010
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0060,012
Science ouverte0,0050,008
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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