Meta-analysis of gene expression in human pancreatic islets after in vitro expansion
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Pancreatic islet transplantation as a potential cure for type 1 diabetes (T1D) cannot be scaled up due to a scarcity of human pancreas donors. In vitro expansion of beta-cells from mature human pancreatic islets provides an alternative source of insulin-producing cells. The exact nature of the expanded cells produced by diverse expansion protocols and their potential for differentiation into functional beta-cells remain elusive. We performed a large-scale meta-analysis of gene expression in human pancreatic islet cells, which were processed using three different previously described protocols for expansion and for which redifferentiation was attempted. All three expansion protocols induced dramatic changes in the expression profiles of pancreatic islets; many of these changes are shared among the three protocols. Attempts at redifferentiation of expanded cells induce a limited number of gene expression changes. Nevertheless, these fail to restore a pancreatic islet-like gene expression pattern. Comparison with a collection of public microarray datasets confirmed that expanded cells are highly comparable to mesenchymal stem cells. Genes induced in expanded cells are also enriched for targets of transcription factors important for pluripotency induction. The present data increase our understanding of the active pathways in expanded and redifferentiated islets. Knowledge of the mesenchymal stem cell potential may help development of drug therapeutics to restore beta-cell mass in T1D patients.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,007 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle