Mammalian Sperm Proteins Are Rapidly Evolving: Evidence of Positive Selection in Functionally Diverse Genes
Notice bibliographique
Résumé
A growing number of genes involved in sex and reproduction have been demonstrated to be rapidly evolving. Here, we show that genes expressed solely in spermatozoa represent a highly diverged subset among mouse and human tissue-specific orthologs. The average rate of nonsynonymous substitutions per site (K(a)) is significantly higher in sperm proteins (mean K(a) = 0.18; N = 35) than in proteins expressed specifically in all other tissues (mean K(a) = 0.074; N = 473). No differences, however, are found in the synonymous substitution rate (K(s)) between tissues, suggesting that selective forces, and not mutation rate, explain the high rate of replacement substitutions in sperm proteins. Four out of 19 sperm-specific genes with characterized function demonstrated evidence of strong positive Darwinian selection, including a protein involved in gene regulation, Protamine-1 (PRM1), a protein involved in glycolysis, GAPDS, and two egg-binding proteins, Adam-2 precursor (ADAM2) and sperm-adhesion molecule-1 (SAM1). These results demonstrate the rapid evolution of sperm-specific genes and highlight the molecular action of sexual selection on a variety of characters involved in mammalian sperm function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».