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Enregistrement W2135659704 · doi:10.3899/jrheum.100437

Disease Phenotypes and Gender Association of FCRL3 Single-Nucleotide Polymorphism −169T/C in Taiwanese Patients with Systemic Lupus Erythematosus and Rheumatoid Arthritis

2010· article· en· W2135659704 sur OpenAlexvenueno aff
Ji-Yih Chen, Chin-Man Wang, Yeong-Jian Jan Wu, SHIN-NING KUO, Chiung-Fang Shiu, Su-Wei Chang, YEN-TSUN LIN, Huei-Huang Ho, Jianming Wu

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRheumatoid Arthritis Research and Therapies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesChang Gung Medical FoundationAmerican College of Rheumatology Research and Education Foundation
Mots-clésMedicineSingle-nucleotide polymorphismRheumatoid arthritisInternal medicineGenotypeSNPAutoantibodyGastroenterologyImmunologyAlleleConnective tissue diseaseAutoimmune diseaseDiseaseAntibodyGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To investigate the association of the functional FCRL3 single-nucleotide polymorphism (SNP) -169T/C with disease phenotypes and susceptibility to systemic lupus erythematosus (SLE) and rheumatoid arthritis (RA) in Taiwanese. METHODS: FCRL3 SNP -169T/C was genotyped in 573 patients with SLE, 670 patients with RA, and 758 controls. Genotype distributions and allele frequencies were compared among the 3 groups as aggregates or as stratified by clinical characteristics, autoantibody profile, and sex within patient groups. RESULTS: Overall, FCRL3 SNP -169T/C was not associated with susceptibility to either SLE or RA. However, -169CC genotype was significantly reduced in leukopenia-positive SLE patients as compared to the leukopenia-negative SLE patients (CC vs CT+TT, p = 6 × 10(-4), OR 0.444, 95% CI 0.279-0.708) and controls (p = 6.1 × 10(-3), OR 0.583, 95% CI 0.396-0.857). On the other hand, -169TT genotypes were significantly more numerous in RA patients with non-destructive disease as compared with patients with destructive disease (CC+CT vs TT: p = 0.007, OR 1.672, 95% CI 1.149-2.432). The -169T allele frequency was also significantly increased in non-destructive RA compared with patients with destructive disease (C vs T: p = 0.010, OR 1.423, 95% CI 1.089-1.859). FCRL3 SNP -169TT homozygous donors were significantly more numerous among female cyclic citrullinated peptide (CCP)-negative RA patients versus female CCP-positive RA patients (CC+CT vs TT: p = 0.019, OR 1.64, 95% CI 1.085-2.479). CONCLUSION: The functional FCRL3 SNP -169T/C appears to play important roles in the development of certain phenotypes such as SLE leukopenia and RA disease severity in Taiwanese patients with SLE and RA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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