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Large-scale genotyping identifies 41 new loci associated with breast cancer risk
Kyriaki Michailidou, Per Hall, Anna González‐Neira, Maya Ghoussaini, Joe Dennis, Roger L. Milne, Marjanka K. Schmidt, Jenny Chang‐Claude, Stig E. Bojesen, Manjeet K. Bolla, Qin Wang, Ed Dicks, Andrew Lee, Clare Turnbull, Nazneen Rahman, Olivia Fletcher, Julian Peto, Lorna J. Gibson, Isabel dos‐Santos‐Silva, Heli Nevanlinna, Taru Muranen, Kristiina Aittomäki, Carl Blomqvist, Kamila Czene, Astrid Irwanto, Jianjun Liu, Quinten Waisfisz, Hanne Meijers‐Heijboer, Muriel A. Adank, Rob B. van der Luijt, Rebecca Hein, Norbert Dahmen, L. Beckman, Alfons Meindl, Rita K. Schmutzler, Bertram Müller‐Myhsok, Peter Lichtner, John L. Hopper, Melissa C. Southey, Enes Makalic, Daniel F. Schmidt, André G. Uitterlinden, Albert Hofman, David J. Hunter, Stephen J. Chanock, Daniel Vincent, François Bacot, Daniel C. Tessier, Sander Canisius, Lodewyk F.A. Wessels, Christopher A. Haiman, Mitul Shah, Robert Luben, Judith Brown, Craig Luccarini, Nils Schoof, Keith Humphreys, Jingmei Li, Børge G. Nordestgaard, Sune F. Nielsen, Henrik Flyger, Fergus J. Couch, Xianshu Wang, Celine M. Vachon, Kristen N. Stevens, Diether Lambrechts, Matthieu Moisse, Robert Paridaens, Marie‐Rose Christiaens, Anja Rudolph, Stefan Nickels, Dieter Flesch‐Janys, Nichola Johnson, Zoe Aitken, Kirsimari Aaltonen, Tuomas Heikkinen, Annegien Broeks, Laura J. van’t Veer, C. Ellen van der Schoot, Pascal Guénel, Thérèse Truong, Pierre Laurent‐Puig, F. Ménégaux, Frederik Marmé, Andreas Schneeweiß, Christof Sohn, Barbara Burwinkel, M. Pilar Zamora, José Ignacio Arias Pérez, Guillermo Pita, M. Rosario Alonso, Angela Cox, Ian W. Brock, Simon S. Cross, Malcolm Reed, Elinor J. Sawyer, Ian Tomlinson, Michael J. Kerin, Nicola Miller, Brian E. Henderson, Fredrick R. Schumacher, Loı̈c Le Marchand, Irene L. Andrulis, Julia A. Knight, Gord Glendon, Anna Marie Mulligan, Annika Lindblom, Sara Margolin, Maartje J. Hooning, Antoinette Hollestelle, Ans M.W. van den Ouweland, Agnes Jager, Minh Bui, Jennifer Stone, Gillian S. Dite, Carmel Apicella, Helen Tsimiklis, Graham G. Giles, Gianluca Severi, Laura Baglietto, Peter A. Fasching, Lothar Haeberle, Arif B. Ekici, Matthias W. Beckmann, Hermann Brenner, Heiko Müller, Volker Arndt, Christa Stegmaier, Anthony J. Swerdlow, Alan Ashworth, Nick Orr, Michael E. Jones, Jonine D. Figueroa, Jolanta Lissowska, Louise A. Brinton, Mark S. Goldberg, France Labrèche, Martine Dumont, Robert Winqvist, Katri Pylkäs, Arja Jukkola‐Vuorinen, Mervi Grip, Hiltrud Brauch, Ute Hamann, Thomas Brüning, Paolo Radice, Paolo Peterlongo, Siranoush Manoukian, Bernardo Bonanni, Peter Devilee, Rob A.�E.�M. Tollenaar, Caroline Seynaeve, Christi J. van Asperen, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Katarzyna Jaworska, Katarzyna Durda, Vesa Kataja, Veli-Matti Kosma, Jaana M. Hartikainen, Natalia Bogdanova, Natalia Antonenkova, Thilo Dörk, Vessela N. Kristensen, Hoda Anton‐Culver, Susan Slager, Amanda E. Toland, Stephen B. Edge, Florentia Fostira, Daehee Kang, Keun-Young Yoo, Dong‐Young Noh, Keitaro Matsuo, Hidemi Ito, Hiroji Iwata, Aiko Sueta, Anna H. Wu, Chiu-Chen Tseng, David Van Den Berg, Daniel O. Stram, Xiao‐Ou Shu, Wei Lu, Yu-Tang Gao, Hui Cai, Soo‐Hwang Teo, Cheng Har Yip, Sze Yee Phuah, Belinda K. Cornes, Mikael Hartman, Hui Miao, Wei Yen Lim, Jen-Hwei Sng, Kenneth Muir, Artitaya Lophatananon, Sarah Stewart‐Brown, Pornthep Siriwanarangsan, Chen‐Yang Shen, Chia-Ni Hsiung, Pei-Ei Wu, Shian-ling Ding, Suleeporn Sangrajrang, Valérie Gaborieau, Paul Brennan, James McKay, William J. Blot, Lisa B. Signorello, Qiuyin Cai, Wei Zheng, Sandra Deming-Halverson, Martha J. Shrubsole, Jirong Long, Jacques Simard, Montserrat García‐Closas, Paul D.P. Pharoah, Georgia Chenevix‐Trench, Alison M. Dunning, Javier Benı́tez, Douglas F. Easton
Notice bibliographique
RevueNature Genetics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensRoyal Victoria HospitalCentre hospitalier universitaire de QuébecRoyal Victoria Regional Health CentreUniversité LavalUniversité de MontréalMcGill University Health CentreMcGill UniversityLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalMcGill University and Génome Québec Innovation CentrePublic Health OntarioUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UK
Mots-clésBiologyGenotypingBreast cancerGeneticsScale (ratio)Computational biologyCancerGenotypeGene
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations1 105
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentnon