Photolabelling the rat urotensin II/GPR14 receptor identifies a ligand-binding site in the fourth transmembrane domain
Notice bibliographique
Résumé
A urotensin II (U-II) peptide analogue containing the photoreactive p -benzoyl-L-phenylalanine (Bz-Phe) in the sixth position was used to identify ligand-binding sites of the rat U-II receptor, also known as GPR14. [Bz-Phe(6)]U-II bound the receptor expressed in COS-7 cells with high affinity (IC(50) 0.7 nM) and was as potent as U-II in the agonist-induced production of inositol phosphate. Photolabelling of the U-II receptor with (125)I-[Bz-Phe(6)]U-II resulted in the specific formation of a glycosylated (125)I-[Bz-Phe(6)]U-II-U-II receptor complex of 60 kDa. Digestion of the 60 kDa complex with endoproteinase Glu-C generated a fragment of 17 kDa circumscribing the labelled fragment to residues 148-286. Digestion of the ligand-receptor complex with endoproteinase Arg-C produced a short peptide of 4 kDa corresponding to fragments 125-148, 167-192 or 210-233. CNBr treatment of the endoproteinase-Glu-C and -Arg-C fragments yielded 2 kDa fragments, defining the labelling site to methionine residues 184/185 of the fourth transmembrane domain. Photolabelling of two mutant receptors, M184L/M185L and M184A/M185A, led to a significant decrease in the overall yield of covalent labelling. Taken together, our results indicate that position 6 of U-II normally occupied by phenylalanine would interact with Met(184) and/or Met(185) of the fourth transmembrane domain of the U-II receptor. This information should be of significant value in the study of the interactions between U-II and its cognate receptor.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».