MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2135746737 · doi:10.1111/j.1574-6941.2010.00845.x

Tetrachloroethene conversion to ethene by a<i>Dehalococcoides</i>-containing enrichment culture from Bitterfeld

2010· article· en· W2135746737 sur OpenAlexfundno aff
Danuta Cichocka, Marcell Nikolausz, Pieter Jan Haest, Ivonne Nijenhuis

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHelmholtz-Zentrum für UmweltforschungEuropean CommissionMcMaster University
Mots-clésDehalococcoidesReductive dechlorinationEnrichment cultureVinyl chlorideElectron donorElectron acceptorMicrocosmDehalogenaseTemperature gradient gel electrophoresisMicrobiologyChemistryBiologyBacteriaEnvironmental chemistryPhotochemistryBiodegradationOrganic chemistryCatalysisHalogenation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A Dehalococcoides-dominated culture coupling reductive dechlorination of tetrachloroethene (PCE) to ethene to growth was enriched from a European field site for the first time. Microcosms were set up using groundwater from a chlorinated ethene-contaminated anaerobic aquifer in Bitterfeld (Germany). Active, lactate-amended microcosms capable of PCE dechlorination to ethene without the accumulation of intermediates were used for further enrichment. After three transfers on lactate as an electron donor and PCE as an electron acceptor, the enrichment was transferred to parallel cultures with one of the chlorinated ethenes as an electron acceptor and acetate and hydrogen as the carbon and energy source, respectively. After three more transfers, a highly purified culture was derived that was capable of dechlorinating PCE with hydrogen and acetate as the electron donor and carbon source, respectively. PCR, followed by denaturing gradient gel electrophoresis, cloning and sequencing revealed that this culture was dominated by a Dehalococcoides sp. belonging to the Pinellas group. Investigation of substrate specificity in the parallel cultures suggested the presence of a novel Dehalococcoides that can couple all dechlorination steps, from PCE to ethene, to energy conservation. Quantitative real-time PCR confirmed growth with PCE, cis-dichloroethene, 1,1-dichloroethene or vinyl chloride as electron acceptors. The culture was designated BTF08 due to its origin in Bitterfeld.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,308
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0200,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFEMS Microbiology EcologyMême sujetMicrobial bioremediation and biosurfactantsTravaux en français237 207