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Enregistrement W2135777664 · doi:10.1080/07060661.2014.920921

Identification of <i>Pythium</i> spp. from the rhizosphere of soybeans in Ontario, Canada

2014· article· en· W2135777664 sur OpenAlexaffvenueabout
Geneviève Marchand, Yuanhong Chen, Nahom Ahferom Berhane, Lai Wei, C. André Lévesque, Allen Xue

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPythium ultimumPythiumDamping offBiologyRoot rotRhizosphereInternal transcribed spacerRibosomal DNABotanySeedlingHorticultureAgronomyRibosomal RNARhizoctonia solaniPhylogeneticsBacteriaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Production of soybean in short-season areas of Canada is affected by Pythium species causing seed rot, seedling damping-off and root rot under the cool, moist conditions prevalent early in the growing season. To determine which Pythium species infect soybean plants under these conditions, soil samples were collected in 2010, 2011 and 2012 from soybean fields in Ontario where symptoms of damping-off or root rot were observed. Pythium spp. were isolated from soil using a seed baiting approach and selective media. PCR amplification and sequencing of the internal transcribed spacer of the nuclear ribosomal DNA allowed for identification of six different Pythium species (out of a total of 104 strains). Pythium ultimum var. ultimum (56.7%) and P. sylvaticum (29.8%) were the most frequently isolated species over all sampling years. Other species isolated included P. dissotocum (6.7%), P. ultimum var. sporangiiferum (3.8%), P. irregulare (1.9%), and P. hypogynum (1.0%).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,664
Score d'incertitude au seuil0,201

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,153
Écart entre enseignants0,145 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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