Stanniocalcin Has Deep Evolutionary Roots in Eukaryotes
Notice bibliographique
Résumé
Vertebrates have a large glycoprotein hormone, stanniocalcin, which originally was shown to inhibit calcium uptake from the environment in teleost fish gills. Later, humans, other mammals, and teleost fish were shown to have two forms of stanniocalcin (STC1 and STC2) that were widely distributed in many tissues. STC1 is associated with calcium and phosphate homeostasis and STC2 with phosphate, but their receptors and signaling pathways have not been elucidated. We undertook a phylogenetic investigation of stanniocalcin beyond the vertebrates using a combination of BLAST and HMMER homology searches in protein, genomic, and expressed sequence tag databases. We identified novel STC homologs in a diverse array of multicellular and unicellular organisms. Within the eukaryotes, almost all major taxonomic groups except plants and algae have STC homologs, although some groups like echinoderms and arthropods lack STC genes. The critical structural feature for recognition of stanniocalcins was the conserved pattern of ten cysteines, even though the amino acid sequence identity was low. Signal peptides in STC sequences suggest they are secreted from the cell of synthesis. The role of glycosylation signals and additional cysteines is not yet clear, although the 11th cysteine, if present, has been shown to form homodimers in some vertebrates. We predict that large secreted stanniocalcin homologs appeared in evolution as early as single-celled eukaryotes. Stanniocalcin's tertiary structure with five disulfide bonds and its primary structure with modest amino acid conservation currently lack an established receptor-signaling system, although we suggest possible alternatives.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».