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Enregistrement W2135961916 · doi:10.1111/ejn.13046

A novel dopamine transporter transgenic mouse line for identification and purification of midbrain dopaminergic neurons reveals midbrain heterogeneity

2015· article· en· W2135961916 sur OpenAlexafffund
Mia Apuschkin, Sara Stilling, Troels Rahbek‐Clemmensen, G. Sørensen, Guillaume Fortin, Freja Herborg, Jacob Eriksen, Louis‐Éric Trudeau, Kristoffer L. Egerod, Ulrik Gether, Mattias Rickhag

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neuroscience · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurotransmitter Receptor Influence on Behavior
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchLundbeckfondenNational Institutes of HealthKrembil FoundationNational Institute on Drug AbuseSundhed og Sygdom, Det Frie Forskningsråd
Mots-clésMidbrainDopamine transporterDopaminergicDopamineNeuroscienceGenetically modified mouseDopamine Plasma Membrane Transport ProteinsIdentification (biology)TransgeneBiologyGeneCentral nervous systemGeneticsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Midbrain dopaminergic (DAergic) neurons are a heterogeneous cell group, composed of functionally distinct cell populations projecting to the basal ganglia, prefrontal cortex and limbic system. Despite their functional significance, the midbrain population of DAergic neurons is sparse, constituting only 20 000-30 000 neurons in mice, and development of novel tools to identify these cells is warranted. Here, a bacterial artificial chromosome mouse line [Dat1-enhanced green fluorescent protein (eGFP)] from the Gene Expression Nervous System Atlas (GENSAT) that expresses eGFP under control of the dopamine transporter (DAT) promoter was characterized. Confocal microscopy analysis of brain sections showed strong eGFP signal reporter in midbrain regions and striatal terminals that co-localized with the DAergic markers DAT and tyrosine hydroxylase (TH). Thorough quantification of co-localization of the eGFP reporter signal with DAT and TH in the ventral midbrain showed that a vast majority of eGFP-expressing neurons are DAergic. Importantly, expression profiles also revealed DAergic heterogeneity when comparing substantia nigra and ventral tegmental area. Dat1-eGFP mice showed neither change in synaptosomal DA uptake nor altered levels of DAT and TH in both striatum and midbrain. No behavioural difference between Dat1-eGFP and wild-type was found, suggesting that the strain is not aberrant. Finally, cell populations highly enriched in DAergic neurons can be obtained from postnatal mice by fluorescence-activated cell sorting and the sorted neurons can be cultured in vitro. The current investigation demonstrates that eGFP expression in this mouse line is selective for DAergic neurons, suggesting that the Dat1-eGFP mouse strain constitutes a promising tool for delineating new aspects of DA biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,104
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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