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Enregistrement W2136073836 · doi:10.1186/1475-2875-12-64

Mitochondrial genome sequences reveal deep divergences among Anopheles punctulatus sibling species in Papua New Guinea

2013· article· en· W2136073836 sur OpenAlexfundno aff
Kyle Logue, E. Ricky Chan, Tenisha Phipps, Scott T. Small, Lisa J. Reimer, Jetsumon Sattabongkot, Peter M. Siba, Peter A. Zimmerman, David Serre

Notice bibliographique

RevueMalaria Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesFaculty of Tropical Medicine, Mahidol UniversityMahidol UniversityFogarty International CenterMcGill UniversityCleveland Clinic
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeMitochondrial DNAEvolutionary biologyReproductive isolationAnophelesPhylogeneticsGeneticsGenomeMalariaGenePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Members of the Anopheles punctulatus group (AP group) are the primary vectors of human malaria in Papua New Guinea. The AP group includes 13 sibling species, most of them morphologically indistinguishable. Understanding why only certain species are able to transmit malaria requires a better comprehension of their evolutionary history. In particular, understanding relationships and divergence times among Anopheles species may enable assessing how malaria-related traits (e.g. blood feeding behaviours, vector competence) have evolved. METHODS: DNA sequences of 14 mitochondrial (mt) genomes from five AP sibling species and two species of the Anopheles dirus complex of Southeast Asia were sequenced. DNA sequences from all concatenated protein coding genes (10,770 bp) were then analysed using a Bayesian approach to reconstruct phylogenetic relationships and date the divergence of the AP sibling species. RESULTS: Phylogenetic reconstruction using the concatenated DNA sequence of all mitochondrial protein coding genes indicates that the ancestors of the AP group arrived in Papua New Guinea 25 to 54 million years ago and rapidly diverged to form the current sibling species. CONCLUSION: Through evaluation of newly described mt genome sequences, this study has revealed a divergence among members of the AP group in Papua New Guinea that would significantly predate the arrival of humans in this region, 50 thousand years ago. The divergence observed among the mtDNA sequences studied here may have resulted from reproductive isolation during historical changes in sea-level through glacial minima and maxima. This leads to a hypothesis that the AP sibling species have evolved independently for potentially thousands of generations. This suggests that the evolution of many phenotypes, such as insecticide resistance will arise independently in each of the AP sibling species studied here.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,299
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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