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Enregistrement W2136104926 · doi:10.1093/cid/ciu326

Editorial Commentary: Pathogenesis From the Reactivation of Chromosomally Integrated Human Herpesvirus Type 6: Facts Rather Than Fiction

2014· editorial· en· W2136104926 sur OpenAlexaff
Louis Flamand

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2014
Typeeditorial
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePathogenesisHuman herpesvirusVirologyImmunologyVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

(See the Brief Report by Endo et al on pages 545–8.) Viral latency, defined by the ability of a virus to remain dormant, is a commonly used immune evasion strategy that enables the long-term persistence of viruses within the infected host. On occasion, these viruses come out of latency and initiate their replicative cycles, yielding a progeny of infectious virions favoring viral propagation and dissemination with possible pathogenic outcomes depending on the immunological competency of the host. Among the most successful viruses utilizing latency as a mean of persistence are herpesviruses. Typically, during latency, herpesviruses maintain their genome in the nucleus in the form of an episome (extrachromosomal circular DNA) and express only a handful of proteins (often 1 protein) that ensure episome maintenance and transmission to daughter cells upon cell division. Among the 100 or so herpesviruses infecting vertebrates, a few of them have evolved mechanisms allowing them to integrate their viral genome into the host chromosomes in manners analogous to retroviruses. Example of such viruses include Marek disease virus (an oncogenic chicken herpes virus) and human herpesvirus (HHV) 6A and 6B (reviewed in [1]). HHV-6A and HHV-6B were isolated in 1986 and 1988 [2, 3], respectively, and the first report on chromosomally integrated HHV-6 (ciHHV-6) made in 1993 [4]. Daibata et al were the first to demonstrate vertical transmission of HHV-6 DNA over 3 generations by showing identical HHV-6 integration sites between a patient with acute lymphoblastic leukemia, his son, and his granddaughter, who were otherwise healthy [5]. HHV-6A and HHV-6B integration can take place in several distinct chromosomes, but the integration site invariably takes place at the ends of chromosomes within the telomeric region [6]. Since then, several other cases of ciHHV-6 were reported (reviewed in [1]) and biological consequences of ciHHV-6 discussed [7]. Whether HHV-6 integration was a viral dead end or constitutes a new form of latency remained, for many years, an unanswered fundamental biological question. Using Epstein-Barr virus–immortalized B-cell lines from subjects with ciHHV-6 and various culture conditions, several investigators proved unsuccessful at rescuing infectious HHV-6, although viral gene expression could be demonstrated [5, 8–11]. Using human cell lines, Arbuckle et al provided the first evidence of de novo integration and successful rescue of infectious HHV-6 virions from ciHHV-6–infected cells [12], suggesting that HHV-6 can reactivate once integrated. The first in vivo evidence of reactivation of ciHHV-6 came from Gravel et al, who provided data consistent with transplacentally acquired HHV-6 originating from the transmission of reactivated ciHHV-6 from the mother [13].

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,036
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,036
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,002
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0040,004
Communication savante0,0060,004
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0270,029
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,335 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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